清朝比明朝更严格：一器由御医、法院判决、内监依次服药；另一器进入皇室。
北京正阳门东江米巷初设清太医院，今东交民巷西口路北附近。“太医院”牌匾挂在太医院大门上。大门前左为“土地祠”，右为“听差处”。太医院有五个大堂，挂着康熙帝皇赐名医黄云的诗：“神圣怎么能再，调方最近的爱情。药性谨慎，仁术一生。医生强调“诚谨仁术”这个词。大堂左侧南厅为御医办公厅，右侧为北厅。后来是先医庙，供奉伏羲、神农、黄帝的雕像，有康熙帝御书“永济群生”匾。先医庙里有铜像，庙外有药王庙，庙连大堂两三堂。
光绪二十七年(1901年)《辛丑条约》后，东交民巷被划为外国驻华使领馆区。第二年，太医院迁至新建衙门，在今地安门东街113号医院，大堂东西三间，深三间，现基本保存。东院是药房。前院有28户居民，后院用于五中分校。太医院在宫内上司院北设有待诊休息的地方，又称“他坦”，又称“塌潭”，为满语音译，汉意为“住房、住所”。岁月流逝，现已无存。
康熙吃西药
——皇帝看病不一定是御医
明清时期的太医院有四个功能：卫生部、总医院、医学院和卫生保健局。康熙32年5月（1693年），康熙皇帝因疟疾服用金鸡纳霜（奎宁）。光绪24年9月4日（1898年），法国驻中国大使馆多德福医生为光绪皇帝开了药。然而，太医院一直以中医为主。
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御医主要有八项职责：侍直、进御、胡从、奉差、储药、祭先医、视狱囚、施药等。侍直，各以专科，分班轮值，在宫中称宫直，在外庭称六直。宫直在御药房和宫外班房值班，六直在外直房(如昌春园、圆明园)值班。胡从、皇帝巡逻、御医或奉旨点使用，或按班轮值，将药材装载到夫马、车辆、账房等物品上。@ 王府、公主府、文武大臣等，太医也奉命去诊病。太医还治疗监狱囚犯和瘟疫患者。@ 御医不一定能给皇帝看病，给皇帝看病的也不一定是御医。
御医怎么当
——想升职，等六年
来自全国各地的御医，从民间医生、举人、贡生等有职称的人中，选择精通医理、愿意为宫中效力的人。如康熙年间，北京同仁堂创始人乐显扬曾任太医院官目一职，其子凤鸣继承父业。雍正年间，同仁堂供奉皇家药房的宫廷药材，前后八代，188年。太医院还设有培养医务人才的教学厅。经过六次寒暑，考试合格后才能录用为医生或医生(光绪《大清会典》卷1150)。他们的晋升规则是六年考一次，成绩合格，没有错，一次晋升。考试受八股文影响，如一次题为“知者乐水，仁者乐山”，还重视书法。太医开药方，字迹端好。这种人事就业和晋升制度的优势是：一是将考试和转移限制在医院内，转移和转移较少，有利于人才队伍的稳定；二是皇家医生、官员、医生采用考试方式选拔，选择最佳就业，有利于提高业务水平。
薪资待遇低
——医生的月薪不如太监
在工资方面，太医院的医院使月银三两，左右医院判决，七品御医均月银二两两，官目和医生月银一两五(光绪《清会典》卷二百五十)。雍正元年(1723年)规定，医生每月给公费饭银一两五钱，米九斗。而一个普通的太监月银二两，可见御医的工资低。
咨询、尝药、备案
——皇帝看病的步骤很多
据《明史·职官志》记载，御医治病有“六要”给皇帝看病：一是组成团队，医院使者、御医和内臣共同负责，相互监督。二是会诊，共同诊断。三是共同选药，联名封记药。四是共同监测煎药。五要共同尝药，即每两剂合一，煎熟，分为两器，一个御医，内臣先尝，一个进御。清朝比明朝更严格：一器由御医、法院判决、内监依次服药；另一器进入皇室。六是脉案方剂存档备查。
药房设有药库储存药品材料。药品材料按定期给价，由药品经销商采购。内部药房的医生切割和加工。清宫药房有御药房、寿药房、东药房、西药房、内药房、外药房、乾清宫药房、武英宫露房、长春宫药房、永和宫药房等多种名称，具有储存药品、油炸药、准备药品等功能。
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著名的医生不是皇家医生，皇家医生也不是著名的医生。清代医学比考证更重要，没有解剖学。康熙皇帝的人体解剖学作品尚未出版，更不用说其他人了？著名医生王清任晚上解剖死刑尸体，参考兽兽和动物，为中国人体解剖学开辟了一座山。后来，唐宗海推广和发挥了《中西汇通医学经典的精髓》。“两个人的启蒙都足以启发后者。”
伴君如伴虎
——戴思恭，明代神医
浙江浦江县人戴思恭，字原礼。洪武帝爱重之，征为御医，治疗立效。燕王朱棣患有病(音“假”)，即蛊胀病，洪武帝派思恭去治。见燕王用的药都对，不明白为什么不起作用，便问燕王好吃什么，回答：“嗜生芹菜(喜欢吃生芹菜)。"思恭说：“得了！《明史》记载：“投一剂，夜暴下，都是细蝗。于是，燕王病愈了。思恭治愈了晋王朱掌病。不久，复发死亡。洪武帝怒不可遏，抓治王府诸医。思恭从容地说：“臣前奉命视王疾，启王说：‘今即愈，但毒在绝症，恐复作，不能治愈。今天果然！诸医因是免死的。洪武帝犹豫不决，少问，出御右顺门，惩罚侍疾无效的御医，独慰思恭地说：“汝仁义人也不怕。不久，洪武帝死了，建文帝立，惩罚了所有的皇家医生，但思恭没有受到惩罚，他被提升为太医院的使者。永乐初，又征人，免其拜。年八十二年，后病卒。
揭露古御医收入:月给公费饭银一两五钱不如太监