后来，他的经历和收获使他获得了巨大的荣誉。因此，他决定进行更大规模的调查，目的地仍然是敦煌，主要是为了更多更好地揭开壁画，搬走彩塑。于是我们开始成立第二个调查小组，由华尔纳、杰恩、丹尼尔·汤普森(负责剥离壁画)等6名成员组成。、阿兰普列斯特，霍拉斯史汀生(负责测绘)、查理德·斯达尔（负责摄影）组成了一个非常专业的盗窃团伙，主要针对莫高窟285个洞穴，准备将所有洞穴搬到美国。华尔纳的第二次调查还有一项任务，那就是在中国找一所与哈佛大学合作研究中国文化的学校，选择北京大学。虽然这种合作因为中国人民的反帝高潮和排外情绪而搁浅，但北京大学的陈万里先生作为中国专家随队西行。虽然陈先生的西行表面上是为了解决一些古代文物和语言困难，但实际上主要是为了防止华尔纳盗窃中国文物，给代表团的活动带来极大的不便，有效地保护了祖国的文物，保护了中国人民的利益。一路上发生的一切都记录在他后来的个人日记《西行日记》中。
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1925年2月16日离开北京，5月19日抵达敦煌。在与县政府接触的过程中，他被拒绝调查千佛洞。华尔纳的第一次破坏使当地人民非常愤怒。他们还向王道士提出了问题，这使得王道士不得不假装疯狂和愚蠢。经过一番讨论，最终给了代表团一系列的限制和规定：
1、代表团成员不得住在千佛洞；
2、代表团成员参观千佛洞，由当地派出的人监视，必须当天返回县城；
3、壁画等文物不得破坏。
不仅如此，当地人还组织了一群人来监视代表团的行动，不时有武力的可能性。在如此严格的监督下，代表团不得不匆忙结束调查活动，5月23日离开敦煌只活动了3天。之后，我去了安西榆林窟，在那里拍了一些照片。1938年，我发表了《万佛峡九世纪石窟佛教壁画研究》。
当时，由于反帝爱国运动“五十”在全国各地爆发，北京大学最终决定不与哈佛大学合作，并命令陈万里与代表团分手，并提前返回学校。考虑到中国的国内情况，美国方面的电报要求华尔纳及其代表团结束活动，因此华尔纳不得不解散代表团，暂停代表团，并于同年8月返回哈佛大学。
敦煌华尔纳做了什么？他为什么要偷敦煌文物？