华峤：“昔刘向父子，世典史籍;马融通博，三入东观。”“及明章二帝，祖述此意，故後世争为图纬之学，以矫世取资。是以通儒贾逵、马融、张衡、朱穆、崔瑗、荀爽之徒忿其若此，奏皆以为虚妄不经，宜悉收藏之。”
范晔等《后汉书》：“马融辞命邓氏，逡巡陇、汉之间，将有意于居贞乎?既而羞曲士之节，惜不赀之躯，终以奢乐恣性，党附成讥，固知识能匡欲者鲜矣。夫事苦，则矜全之情薄;生厚，故安存之虑深。登高不惧者，胥靡之人也;坐不垂堂者，千金之子也。原其大略，归于所安而已矣。物我异观，亦更相笑也。”
“季长戚氏，才通情侈。苑囿典文，流悦音伎。邕实慕静，心精辞绮。斥言金商，南徂北徙。籍梁怀董，名浇身毁。”
“若李固、周举之渊谟弘深，左雄、黄琼之政事贞固，桓焉、杨厚以儒学进，崔瑗、马融以文章显，吴祐、苏章、种暠、栾巴牧民之良干，庞参、虞诩将帅之宏规，王龚、张皓虚心以推士，张纲、杜乔直道以纠违，郎顗阴阳详密，张衡机术特妙，东京之士，于兹盛焉。”
刘峻：“马融海内大儒，被服仁义。”
刘勰：“马融鸿儒，思洽识高，吐纳经范，华实相扶。”
萧统《昭明文选》：“融既博览典雅，精核数术，性好音，能鼓琴吹笛。”
洪迈：“按马融、皇甫规之言晓然易见，而所请兵皆不过五千，然讫不肯从，乃知宣帝纳用赵充国之册为不易得，所谓明主可为忠言也。”
徐钧：“士迫饥寒已变初，权门宁免曳长裾。帐纱所学明何事，却陷忠良草奏书。”
陈元靓：“季长慱洽，为世通儒。名立训传，善诱生徒。东观文炳，南国化孚。躬圭之赠，明我弁符。 ”
《日知录集释》：“扬雄之事莽，戴圣之赃吏，马融之附势，王肃之画篡逆策，吴澄之忘宋仕元，俱无容平反。”
《剑桥中国秦汉史》：我们可以看出一种开始脱离帝国太学的趋势，这在后来出现于东汉的独立的经学研究的私家学校中反映了出来，这些学校以马融(79—166年)和郑玄(127—200年)办的最为著名。
马融的历史评价 东汉时期著名经学家