保科正军(1510-1592)，日本战国时期的武士，保科正则之子，武田家族的家臣。他擅长用枪，被称为“枪弹正”、高坂昌信(逃弹正)又称“武田三弹正”。
清和源氏赖信之子井上赖季的后裔保科氏出生于信浓国保科。正则一代人开始住在信浓伊奈郡高远城。正则儿子是保科正俊，武田家的名将(1510～1592)他先后侍奉武田信玄和武田胜赖，并立下多次战功。因为他擅长用枪，所以被称为枪弹正，他和真田幸隆(攻击弹正)、高坂昌信(逃之弹正)并称武田三弹正。
天文十一年(1542年)，正军的儿子出生在高远城。和他的父亲一样，正直也服务于信玄和胜赖。天正十年武田灭亡时，正直帮助信玄的五子仁科盛信守护高远城，顽强抵抗织田军的进攻。然而，由于寡不敌众，高远城最终陷入困境，盛信自杀，正直在落城前逃跑。
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武田氏灭亡后，依靠小田原的北条家再次崛起，帮助北条势夺得高远城，再次回到高远城，成为城主。之后，德川家族与北条家族在甲斐国发生冲突，正直通过酒井忠次的介绍投靠了德川家族，并被家康赋予了伊奈县一半的领土。正直也开始了对田中城的策略，因为他没有说服同郡吉轮城的城主藤泽赖。
天正十二年，正直迎娶家康的异父妹妹多为妻，从而正式保证了他在高远城的地位。天正十三年来，石川数正和小笠原贞庆一起攻击高远城，但被正直击退，小笠原家的几位将领被讨回。
保科氏正式成名始于正光(1561)～1631)一代。正光是正直的直子，正室是真田昌幸的四女。正光从小就为家康服务，并随正直参加了小牧家康移封至关东后，长期的手战和小田原之战，正光被赋予了总国多胡一万石的领地。关原合战后，正光被转封到保科氏旧领地高远城，领有2500块石头。由于大坂之战时守卫淀城，立下战功，领地被封为三万石。
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之后，正光收养了德川秀忠将军的三个儿子作为养子，并将家庭主管的位置让给了正之，正之将姓氏改为松平。宽永十三年(1636年)，松平正之被封在羽毛出20万石头上，后来又增加了3万石头，移封到会津若松。幕末的松平容保是正之的后裔。
和正光一样，正直的三子正贞(15888)～1661)小时候，家康也很近。他的母亲是家康同母异父的妹妹(久松佐渡守的长女)。元和元年(1615)
正贞和正光一起参加了大阪夏之战。宽永14年(1637年)，松平正将保科家传下来的宝物让给正贞，让保科旗本家得以生存。庆长七年(1648年)，正贞被封为上总国饭野，领有1700块石头。
保科正军:日本战国时期的武士，武田三弹之一