司马丕出生于咸康七年(341年)。他出生后的第二年，他的父亲司马衍去世了。咸康八年(342年)，司马丕被授予郎邪王称号。晋成帝去世后，司马丕本应登基，但中书令于冰以司马丕年轻为由反对，因为他担心登基后会失去权力，所以司马丕的叔叔晋康帝司马岳登基改元建元。
皇帝的位置让叔叔坐着，他不得不做一些象征性的闲置工作，永和元年（345年），崇拜散骑。永和12年（356年），加拿大中国将军。晋升三年（359年），担任一名将军。事实上，这是一些虚荣心，他不能带领军队战斗，杀死敌人。
五年(361年)5月，19岁的晋穆帝司马丹去世，皇帝没有儿子。皇太后楚蒜子说司马丕应该登基为皇帝。他是皇室正统，现在没有人比他更适合当皇帝了。于是司马丕登基当皇帝，皇帝的位置转了一圈，交回了屁股。
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“男人汉大丈夫如果不能流芳百世，宁愿遗臭万年。”历史上说这句话的名人是桓温。
桓温(312-373年)，字元子(一个符子)，乔国龙亢(今安徽怀远龙亢镇)。东晋政治家、军事家、权臣、乔国桓氏代表人物，东汉名儒桓荣后，宣城石桓彝长子。
桓温是晋明帝司马绍的许可。他因追溯河流而灭亡成为汉政权而出名。他三次出兵北伐(北伐前秦、羌族姚襄、前燕)，战功累累。独揽朝政十余年后，他操纵废立，故意夺取帝位。最后，他的名声因第三次北伐失败而受损。由于朝鲜国王的感谢，他没能得到他想要的。
桓温晚年强迫朝廷加其九锡，但由于谢安等人的借口，他推迟了，直到死亡。死后，他的头衔是宣武。他的儿子桓玄成立桓楚后，追求“宣武皇帝”。
以下是桓温前半生的辉煌经历:
15岁时，父亲被杀，立誓要报仇雪恨，重振家业；
19岁时，桓温假扮吊客，混入敌人丧礼，手刃其三子，以此闻名于世，并被皇室招为徐，作为政治新星步入仕途；
33岁时是晋康帝司马岳时期。为了削弱在荆州传承了两代的余氏，司马玉不允许父亲继承，任命桓温镇荆州，都督西部六州；
41岁时，晋穆帝司马丹在位时，司马玉命令尹浩率领北伐，希望他能建立功绩，制衡桓温。不知道连续大败，朝野共愤。司马玉强迫桓温罢免殷浩。桓温从此夺取了朝中内外的权力。
五十二岁，晋哀帝司马丕在位，桓温主持“庚戌土断”，打击士族豪强，极大地增强了国力。
如果桓温的生命到此结束，他在中国古代历史上的声誉将达到更高的水平。不幸的是，他仍然活着，所以他晚年被迫废除皇帝的故事出现了，所以他生病了，被骂了。
桓温给后人留下了许多成语典故，许多人比他自己更出名：
他出生在一个士族，但他鄙视清流。每次读《高士传》，他都会放弃自己的书；他谴责家庭高门造成的“中国陆沉”的无能，并嘲笑他们是一群“刘景升之牛”的废物。他叹了口气，“我不是老兵。我怎么能坐得很高？”
他的谋主是“入幕之宾”的习超；妻子对情敌“我见犹怜，更别说老奴了”;就连他的主薄也善于辨别美酒，管好酒叫“青州从事”，劣酒叫“平原督邮”。
在行军的路上，他同情因思子“心碎”的母猴，惩罚捕猴的士兵；看到前几年种下的柳树，他叹了口气：“树就是这样，人怎么能忍受呢？”，甚至哭了起来；
他是世界著名的孝子。他为父亲报仇，枕戈哭了三年血。他解决了自己的权威，为母亲埋葬了他。然而，他在绝壁天空中高呼“如果你是忠臣，你就不应该是孝子”;
@ 他终于喊出了中国历史上的那句名言：既不能流芳后世，也不能复遗臭万载邪！
有桓温这样的权臣当政，晋哀帝司马丕就像傀儡。他没有心思把它放在朝廷的政治事务上。司马丕一直喜欢长生不老的艺术。根据道士传授的长生法，他断谷服药。侍中高松说：“这不是一件好事。陛下不应该这样做。”哀帝不听。结果，他在床上生病了。他不能听政治事务。桓温和其他大臣商量后，邀请崇德太后楚大蒜摄政。
兴宁三年(365年)正月一日，王穆之皇后去世。同月，司马丕因服药过多死于西堂，25岁。埋在安平陵。司马丕死后，他的头衔是悲哀的，他和王后一起埋在安平陵。
在中国历史上，大约有10位皇帝直接服用长生不死的药物而死，司马丕是第一位哀悼皇帝。司马丕没有后代。他死后，皇太后楚大蒜发布了一项法令，司马丕的弟弟郎邪王司马奕继承了皇位。
为什么司马丕会毒死？真相是什么？