扬州城破后，史可法的下落成了一个永恒的谜。当时，洪承类曾问：“果死耶？还没死？”此后，有许多关于史可法下落的记载和传说。
“数梅花亡国泪，两分明月故臣心。”这是扬州史公祠著名的对联。梅花、明月、亡国、故臣，这些苍凉悲伤的话语，让人想起了200多年前死去的民族英雄。
史可法，字宪之，号道快，明万历三十年(1602)出生于河南祥符，即今开封。明太祖时，他的祖先做过百户锦衣，官虽不高，却是皇帝的近臣。祖父是万历间举人，做过知州，为官廉洁。父亲没有名气，是个本分人。史可法的祖父曾经说过：“我家必昌！可见家人对史可法的出生充满了期待。然而，史可法出生时，不仅家运不好，国运也更差。3月18日，崇祯十七年(1644年)，李白成率领农民军攻破北京，第二天凌晨，崇祯皇帝挂在煤山的槐树上。史可法一心想苦苦支撑的明朝大厦，一夜之间就倒塌了。
顺治二年(1645)初，摄政王多尔根命令豫亲王多多，按照原计划，从西安转兵，直奔东南，前往南京消灭南明洪光政权。洪光政权是南方明朝的官僚。得知北京沦陷，崇祯皇帝殉国后，他在南京拥有福王朱由松政权，继续明朝正统。
今年7月，多尔贡致书南明“领袖名人”、扬州东阁大学士、督师史可法指责其拥立福王称其为非法，应立即削号归藩，则“永绥福禄”。并引诱说“南州群彦翩然来仪”，即南明臣僚投降我清朝，就像对待降清的吴三桂一样，“列爵分土”。警告史可法“取舍从违，应早审批”，而“南国安危，此举”。这是一本劝降书。虽然史可法没有被它感动，但他仍然天真地幻想着“坚同仇之友，全始终之德，合师进取，问罪秦中”。但同时也表达了忠于报国的态度：“今天的法治，鞠躬致命，克尽臣节”。
顺治二年(1645)正月，被清收购的明总兵许定国诱杀了明江北四镇之一的兴平伯高杰。史可法失去了一位收复失地志向很强的抗敌将领，深感清兵随时都会南下，必须加强河防。紧急调兵遣将，部署堵御事宜，不料行动迅速的多铎已率兵杀人。二月初八，多铎奉旨前往南京，分兵三路挺进，三月二十二日归德(今商丘市南)，二十九日下英州(今阜阳)。
四月十九日，多铎大兵包围扬州。多铎命令各军暂停攻城，以活捉史可法。在此之前，多铎已遣使致信史可法，署名“豫王致书史老先生阁下”，史可法却将其书转向朝廷。后来多铎又连续五六次发出招降书，但史“不起，投之火中”。至此，多铎无奈之下，又命令明降将李遇春带着书到扬州城下劝降。史可法怒斥其变节通敌。李遇春说：“公忠义闻华夏，不信朝，死何益也！史可法怒不可遏，使发箭射李。
多铎在多次投降失败后，知道史可法殉国的志向是不可移动的，于是加大了攻城力度。25日，扬州城破后的几天，多铎命令清军大开杀戒，留下了屠杀扬州十天的历史记录。
扬州城破后，关于史可法的下落成了一个不解之谜。当时洪承类曾问:“果死耶？还没死？”从那以后，有很多关于史可法下落的记载和传说。
有人说，史可法在城破时逃离城市。具体的逃生过程各执一端。一是为了离开城市，吉六奇在《明季南略》中写道:4月25日，清兵诈称明总兵黄晓的援兵到达，史可法令开西门放行，清兵进城，即攻击明军。史可法在城上看到这种情况，知无可挽回，即拔剑自杀，左右相救，然后与总兵刘肇基潜入城市。二是跨骡子出城。乾隆的《江都志》载扬州老话:城被破的时候，史可法“跨白骡子出南门”。为此，有人写诗:“相公誓死，依然喝泣。120骑着城头站着，城市瞬间被摧毁，铁被骑走，青骡一去不复返。”
康熙时期，孔尚任《桃花扇》，认为史可法死于沉河。史可法出城后，骑马渡河，因马摔倒溺水身亡。或者他出东门被清兵拦截，自觉无望，就是去水里自杀。
还有，当清兵破扬州时，史可法消失了，不知道该怎么办。吉六奇于顺治六年(1649)外出，途中乘船遇到嘉兴人，声称扬州抗清失败后逃脱。他说，城市破碎时，史可法下落不明。
通过对清代史料的分析，一般史家认为史可以在扬州之战中被俘。清实录云：“征服扬州城，获其阁部史可法，斩军前。“明史说，史可法自尽未遂，被部将拥到小东门，为清军抓获，史可法大喊：“我的史督师也是。”遂遇难。史可法的继承人史德威在《维扬殉道纪念》中写道，扬州城陷时，史可法自杀未遂，为清军捕获。多铎对史可法“相待如宾，口呼先生”，并劝说：“为我收拾江南，不惜重任。史可法回答说：“我是天朝重臣，怎么肯苟且偷生，做万世罪人！我的头可断，身不可屈...城市死亡，我意已决，即劈尸万段，甘如其乐”，丁被杀。@ 史可法在4月20日左右为母亲、妻子、叔叔、兄弟、继承人史德威写了五份遗书，都表达了“一死报国，固其分”的坚定态度。由此可见，他早已抱定了一颗死心，说自己能逃脱似乎是不可信的，他的部门在扬州城陷之前已经中流矢而死，不可能和史可法一起“潜城”。
史可法殉难之谜:为什么史可法的下落是一个永恒的谜