《墨子》思想丰富，其中政治思想、伦理思想、哲学思想、逻辑思想和军事思想突出，特别是其逻辑思想，是先秦逻辑思想史的基础。
墨子的政治思想主要体现在尚贤、《尚同》、《非攻》、《节用》、《节葬》、在《非乐》诸篇中。墨家主张任人唯贤的用人原则，反对任人唯亲。它说，官员不可能总是高尚的，普通人也不可能总是廉价的。它主张，从天子到下面的各级官员，都要选择世界上的贤人来充当。墨子反对统治者发动的侵略战争，支持被侵略国家，为此奔跑呼啸，勇敢主持正义。墨子对统治者过着奢侈淫秽的侵蚀生活极为反感，主张限制统治者。墨子主张节俭，反对对死者的葬礼铺张浪费。这些客观地反映了大多数劳动人民的愿望和要求。
墨子的伦理思想主要体现在《兼爱》中、《亲士》、《修身》等文章。墨子主张同时相爱，交相利，不分高低，人们都要互爱互利，这样社会上就不会出现以强欺弱、以贵欺廉、以智欺愚的现象。国君要爱有功贤臣，慈父要爱孝顺的儿子。人穷的时候不要怨恨，富的时候要讲究仁义。对活着的人要仁爱，对死去的人要悲痛，这样社会就会走向大同。墨子的伦理思想虽然抹去了阶级性和幻想性的色彩，但却是广大劳动人民要求平等、抗压迫、呼唤自由的心声。
墨子的哲学思想主要体现在非命中、《贵义》、《尚同》、《天志》、《明鬼》、在《墨经》的诸篇中。认识论是墨家哲学思想最大的贡献。墨子提倡将知识分为两部分闻知、说知、亲知三类，闻知是传授的知识，说知是推理的知识，亲知是实践经验的知识。这否认了唯心主义的先验论。
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为此，墨子在认识论上提出了名字三表法，他说：
有本之人，有原之人，有用之人。在哪里？上本是古代圣王的事。在哪里？下原观察人民耳目一新。为什么？废以为刑政，观察国家人民的利益。这个所谓的词有三种表格。
墨子也反对儒家的倡导天命论，他不相信天命他提倡存在尚力。在名、实墨家在关系上认为名必须服从实，没有实作基础，名是假的。所有这些思想都具有唯物主义的性质。但墨子又相信了天志，他认为天有意志，天能赏善惩恶，爱人恨人。他还论证了鬼神的客观存在，不可避免地陷入了唯心主义的泥坑。这说明墨家唯物主义思想还存在缺陷，还不彻底。
《墨子》的逻辑思想主要体现在《经》、《经说》、《大取》中、在六篇文章中，这主要是后期墨家的思想。后期墨家在《墨经》中提出辩、类、故等待一套完整的逻辑概念。辩论的作用在《小胜》一文中得到了探讨，即辩论是分析是非的区别，审查混乱治理的规律，找出相似之处，调查真相，判断利益，解决疑似问题。还阐述了辩论的几种方式，对推理的研究也非常精细。后期，墨学建立了相当严谨完整的逻辑理论，在我国逻辑思想发展史上发挥了开创性作用，具有较高的学术地位。直到今天，它仍然是人们学习中国逻辑思想史的重要材料，给人们智慧的启迪。
墨子的军事思想主要体现在备城门上、《备高临》、《备梯》、在《备水》等文章中。因为墨家学派主张兼爱、非攻，反对侵略战争，其军事理论主要是积极的防御战术，虽然没有军事思想那么全面和深刻，但它反映了大多数劳动人民对战争和和平的心理愿望。
《墨子》一书包含了极其丰富的思想，在中国思想发展史上具有重要的学术地位。《墨子》的思想代表了劳动人民的利益和要求，是劳动人民智慧的结晶。这样，它就不会受到统治阶级的赞赏。在秦汉时期，墨水的影响不大，墨水的行为知之甚少。就连历史学家司马迁也为墨子传播了数字。
墨子的主要思想：提倡任人唯亲的用人思维