自江户时代以来，就有很多关于卑弥呼等同于古事和日本书纪中的人的讨论和研究。不管什么说法是真的，可以肯定的是，这将大大改写日本古代史。
天照大神说
根据天文学的计算，247年3月24日、248年9月5日和北九州可以看到两次日食。这样的说法和日本神话中天照大神躲在天岩户里，世界被无光记录下来(ja:岩戸隠れ)一致性。此外，通过统计学的方式，利用皇帝的平均在位期间进行计算，也可以得到卑微时代与天照大神时代重叠的计算结果。
因此，松本清张、井泽元彦等人提出了卑弥呼被暗杀的说法。当日食发生时，代表侍奉太阳神的巫女卑弥呼的精神力量消失了，因此被邪马台国人民杀害。这种说法认为，在卑弥呼被暗杀后，邪恶的马台国一度陷入混乱，直到下一个侍奉太阳神的巫女台被选中并安顿下来；这就是日本书记中曾经躲在天岩户的天照神再次出现的记录的来源。然而，这种暗杀说有太多的部分是基于想象的，所以也有很多意见不同意。
如果卑弥呼真的是天照大神，那么邪马台国必然位于九州。那么，目前还不清楚为什么位于九州的邪马台国何时东迁到首都地区。有句话说，东迁是历史上神武天皇的东征，但还有待进一步研究。
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日迹日百袭姬说
日本书纪中也叫日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本日本。
传为日本书纪中日日百袭姬的墓葬，古墓后圆部直径约160米，这与魏志日日人传中的墓葬有关。「卑弥呼死去 卑弥呼以死 大作冢 径百馀步」记录是一致的。
长期以来，对上述论点的反驳最有力的说法是，从三世纪末到四世纪初，筷墓古墓的建造年代与卑弥呼所在的时代不符。但最近，利用年轮年代法推定的考古研究指出，古墓时代的开始可能比目前想象的要早。这样，上述筷墓古墓的建设时代可以追溯到与卑弥呼末年(248年间)相同的三世纪中期，因此这一理论再次受到重视。
神功皇后说
在日本书纪的神功皇后纪中，直接引用了魏志日传中关于卑弥呼的相关记载。然而，自江户时代以来，就有关于卑弥呼是否真的是神功皇后的讨论。根据这一理论，邪马台国必须位于大和王权后来建立的首都地区。
根据反驳意见，神功皇后的儿子应该是神皇和他的母亲，祭祀八旗神的宇佐神宫（大分县宇佐市），这与大和王权所在地相去甚远（但也有意见指出，神功时期大和王权与朝鲜半岛之间的交流增加，因此在濑户内海沿岸设立祭祀神功的八旗宫并非不合理）。虽然少数学者认为日本书纪的相关记录是为了将大和王权和卑弥呼连接起来，但他们只知道一个，不知道另一个。古墓时代的墓葬采用弥生式，埋有邪马台王室的镜子、丝绸、勾玉、日本刀、弥生等物品，清楚地证明大和王权是由邪马台国演变而来的。
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熊袭的女酋长说
本居宣长倡导的理论。本居宣长认为日本自古以来就是一个独立的国家，不能同意魏志日本人传下卑弥呼魏朝贡的记载，并被封为日本国王。因此，宣长提出卑弥呼是九州南部熊袭地区的女酋长，自称是日本国王，并与魏交朋友；这避免了皇帝的祖先向中国贡献的可能性。然而，这一理论被认为是本居宣长的个人独断意见，并没有受到重视。
卑弥呼=卑弥呼
卑弥呼是卑弥呼，在今天可见的史书中没有明确记载的理论。日本本身的历史书中没有记载魏志日人传上记载的日本邪马台国事件。因此，这一理论认为卑弥呼所统治的政权是在3世纪中期～后期灭绝是因为没有必要把卑弥呼及其统治的邪马台国对应到现存的历史书上。这一理论可以说是以相对简单的方式解决了与卑弥呼邪马台国相关的问题；但是，是否有足够的证据支持这一理论还有待研究。
倭姫命说
日本学者内藤湖南认为，卑弥呼可能是垂仁天皇的皇女大和姬命。
卑弥呼的历史原型是什么？日本历史上真的有这个人吗？