明代熟悉的科学成果，如李时珍的《本草纲目》、宋应星的《天工开物》，几乎所有受过中等教育的中国人都知道一两个。但还有两个重要的科学成果，专业人士很少知道。一是朱载宇计算了12个平均法；二是吴有性发现了新的病因。不幸的是，这两个结果在清朝都被不同程度地扼杀了。
一、明朝医学的新曙光
李时珍的《本草纲目》是传统本草学的延伸和完善。它不仅现在受到重视，而且当时也受到了很多赞扬。由于否定了传统的病因理论，吴有性的瘟疫理论在清朝受到了很多批评。
中国古代医学理论将致病原因归咎于所谓的“七情六淫”。七情是喜怒哀乐爱恶欲，是指内在的心理因素；六淫是风寒暑湿燥火，主要是外部气候因素。瘟疫在明末流行。在医学实践中，吴有性发现瘟疫的病因不是气候因素，而是一种“杂气”。杂气病与气候寒暖无关，病情更严重。他称这种气为“怒气”或“怒气”。这种气，“其来无时，其无方”“各随其气而为诸病”(吴有性瘟疫论卷下杂气论)。也就是说，这种气有很多种。疾病有很多种。以前认为麻风、中风等是风，其实不是风；以前认为疮痈、肿毒、痘疹都是火，其实不是火；以前认为霍乱、疟痢是暑，其实不是暑。根据传统的风、寒、暑、湿等方法，没有一种能起作用。他们生病的原因不是气候因素，而是杂气。
吴有性详细描述了杂气病的特点，以解释杂气病，而不是所谓的风、寒、热、湿病：
1、 杂气不在“六淫”或五运六气之内；
2、 无论老少强弱，遇到它都会生病；
3、 杂气病不是先侵入皮肤，然后从表到内，而是从口鼻进入；
4、 侵犯的部位，内不在脏腑，外不在经络。“去表不远，靠近胃。是表里的边界，是半表半里。”;
5、 杂气致病，有的中之发，有的要等机会。比如“遇到饥饿饱劳，忧愁愤怒，正气受伤”才发作；
6，、杂气引起的疾病不同于伤寒。伤寒发热恶寒，只热而不恶寒。类似疟疾，但疟疾不传胃；
7、 感冒风寒有外因，杂气引起的疾病为“时疫”，无感冒风寒外因；
8、 杂气引起的疾病会传染；
9、 杂气引起的疾病可以不治自愈，医生经常冒功；
10、 杂气虽然也是天地之气，但实际上是方土之气。它从地上升起；
11、 有某种杂气，就有某种疾病；
12、 牛瘟、猪瘟等动物病也是由杂气引起的。有时猪病和牛不病，可以看出它们感染的气体也不同；
13、 传统的汗、下、吐三法治不好杂气所致。
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即使从今天的角度来看，吴友也很难对杂气引起的疾病的特征更加挑剔。特别是他指出，杂气往往比六气引起更多的疾病，而杂气往往发生在饥饿和寒冷之前。这种情况表明，六气之后，真正的病因是杂气。如果我们能区分杂气的类型，找出有针对性的治疗方法，那将是新医学的曙光。
然而，瘟疫论持续了两年后，吴有性遭受了亡国之痛。他自己的命运是什么？未知。新王朝有新的需求和新的学术氛围。吴有性对瘟疫的新认识和治疗瘟疫的新方向几乎被打断。
二、清朝明代医学新曙光的熄灭
清朝编辑了《四库全书》，收入了《瘟疫论》。然而，编辑们基本上不知道什么是“杂气”。这本书的摘要仍然认为吴“以四时不正之气为瘟疫”。换句话说，吴有性发现的“杂气”仍然被描述为传统的气候因素，如“五运六气”。然而，吴有性的“杂气”与气候因素无关，只与地区有关。
《四库提要》没有介绍吴有性的“杂气”理论，只介绍了吴对发病过程和症状的描述。然后说:
在所谓的数百瘟疫中，偶尔会有一种伤寒；在数百人的伤寒中，偶尔会有一个阴证。不可避免的矫妄过直。
从今天的角度来看，可以说数百场瘟疫都是伤寒。几乎没有一位富有研究精神的乾佳学者愿意调查吴有性的结论，《四库全书》的编辑也不理解吴有性的结论。随后，《四库总结》搬出了古人衡量是非的标准：
但古人以瘟疫为杂证，医书常附见，不立专门。或误解“素问”“冬伤寒，春必病温”的文章，妄施治疗。
事不师古，又妄施治疗。这可以说是对医生最严厉的批评。还有，吴有性的文章也写得不好:
这本书不太解读，就像笔录一样。
《四库总结》经常为许多科学辩护，认为专家不需要论文的优缺点。然而，对吴有性来说，这是另一种待遇。它对吴有性的厌恶可见一斑。
另一方面，《四库全书》的编辑承认，《瘟疫论》的出现，使得治疗瘟疫的人“有绳墨可守”，可谓“有功于世”。一方面，他尖锐地批评瘟疫论不合古，甚至妄施治疗。这种矛盾反映了当时医学界复古尊经的严重倾向。这种倾向使吴有性瘟疫理论逐渐淹没在传统的七情六淫中。100多年后，欧洲大陆巴斯德发现细菌是致病原因，从根本上改变了西医的面貌。
吴有性的理论对后人有什么影响？为什么他是明朝医学的曙光？