刘秀即位后，却没有定都，定都在哪里？当时人们心目中的重点当然是长安，但长安短时间内拿不到。刘秀在河内郡徘徊了一个多月，最终确定都是洛阳。他先派兵占领了五社津(今河南巩县北)等要塞，防止荥阳以东的割据势力前来争夺，然后下令包围洛阳。当初刘玄去长安的时候，留下李轶和朱金枪守洛阳，两人都劝刘玄杀刘演，是刘秀的敌人。李轶愿归降，刘秀说，他为人诡诈，反复无常，把李轶的信交给太守、郡尉一级官员传阅，说对这类人要提高警惕。
朱金枪很快就知道了这个消息。他认为李轶的行为是背叛他，所以他派人刺杀了李轶。朱金枪暗杀李轶，造成洛阳军队混乱。刘秀一箭双雕，不仅分化瓦解了敌人，还用刀除掉了敌人。洛阳被包围后，刘秀派原朱枪部下尉岑彭劝朱枪投降。朱枪在城里回答说:“我知道我犯了太多罪，不敢投降。刘秀说：“做大事的人不在乎小怨恨。如果朱金枪现在投降，能保住官爵，怎么能杀死他的头昵呢？我向面前的黄河发誓，绝不食言！岑彭又去传达刘秀的话，朱金枪不相信，从城里放下一根绳子，对岑彭说：“你的话当真，就跟着绳子走，”岑彭抓住绳子就上去了。朱金枪看到没有欺诈，同意投降，把自己绑起来，要岑彭陪他向刘秀请罪，刘秀亲自解开绳子，要岑彭连夜把他送回洛阳。第二天一早，洛阳守军大开城门，全部投降刘秀。刘秀任命朱金枪为平狄将军，并封他为扶沟侯。
刘秀严禁军队进城暴掠夺，将军萧光违反军纪，纵兵横暴，处死刑，洛阳迅速安定下来。
刘秀或多或少地使用了赤眉起义军。刘秀即位后，他们从合作伙伴变成了敌人。赤眉军是一群没有战略眼光的流寇，所以他们抢了一个城市，吃了一个地方，也就是说，他们放弃了，然后搬到了其他地方。在流动过程中，一路被追击拦截，损失惨重。
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建武三年(公元27年)正月，赤眉军至宜阳，疲惫不堪。突然发现刘秀亲带领军队在那里等了一会儿，不知所措地投降了刘秀，并把在长安获得的传国玉玺交给了刘秀。此时赤眉军还有十几万人，兵甲器械堆放在宜阳市西与山一般高。刘秀下令给饥饿的投降士兵送食物。第二天，他们聚集在洛水岸边，让首领观看，对范崇等人说：“你后悔投降吗？”现在，让你们各回军营，指挥你们的军队，和我决定胜负。我不想强迫你投降。徐宣等人磕头说：“我们出了长安，君臣就商量归降听命，只是老百姓无知，不能提前告诉他们。现在能投降，就像走出虎口，回到慈母的怀抱，真心欢喜，一点也不后悔。刘秀不无蔑视地说：“你是钝刀中的快刀，是庸人中的能人。刘秀安排范崇等赤眉军将领及其妻子住在洛阳，给了他们田宅。后来，范崇等欲图再谋反，被刘秀发现后杀害。
公孙述，字子阳。王莽天凤年间，任蜀县太守，以其能力闻名蜀中。新末天下乱七八糟，公孙述也起兵割据巴蜀。两年前，刘璇派遣益州刺史张忠等1万多人接管巴蜀和汉中。公孙告诉他蜀国的危险，他们的心属于他。因此，他们有自力更生的抱负，所以他们的弟弟孙恢在绵竹大败。从那时起，公孙的名字震惊了益州。
曹李熊告诉公孙:“方今四海波荡，匹夫横议。将军割据千里，地什汤武。如果奋威德投天空，霸王之业就会成功。名字应该改，镇上的人应该改。”这句话与公孙述的心是一致的。不久，公孙述在成都自立为蜀王。
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蜀地沃野千里，兵精粮足。关中、荆州等地的人闻蜀地太平，安居乐业。为了避免战争，他们纷纷奔赴蜀地。西南夷也派使纳贡，益州蓬勃发展。此时，李熊复对公孙说：“今山东饥荒，人相食；兵所屠杀，城邑丘墟。蜀地沃野千里，土壤肥沃，果实生长，无谷而饱。女工之业，覆衣天下。名竹干，器构之饶，不胜用，又有鱼、盐、铜、银之利，浮水转水。北据汉中，杜褒、斜之险；东守巴郡，拒守关口；地方数千英里，士兵不下百万。见利则出兵略地，无利则坚守，力农。东下汉水窥秦地，南顺江流震荆杨。所谓用天因地，成功之资。今天的君王之声，闻天下，名字未定，志士孤疑，宜即大位，使远人依归。经深思熟虑，公孙述遂于公元25年初，在成都即皇帝，建元“龙兴”。
成为皇帝后，公孙派将军侯丹开白水关，北守南郑；将军任满从阆中下江州，东据捍卫。因此，公孙告诉了所有的益州之地。失败后，刘秀专门从事东方工作，没有时间西顾。关中的许多英雄带领军队回到西蜀，蜀势恢复。
公孙述大修营垒，多置车马，操练兵马，西蜀聚甲数十万。此外，公孙述还在汉中囤积了大量粮草，制造了十层豪华战舰，并多次印上了天下州牧的印章。建武五年(公元29年)，割据荆州的秦峰被刘秀打败，其下属将领延岑和田戎归公孙述，延岑被封为大司马，田戎为翼江王。建武六年(公元30年)，公孙述遣田戎出江关，收拢其旧部，欲取荆州，结果无功而返。
这时，刘秀基本统一了东方，开始规划西北陇右和蜀中公孙的故事。于是他写了一本公孙的故事，说:“天下神器，不能争，要留三思。”手书的签名是“公孙皇帝”。看来当时公孙的势力挺大的，连东帝刘秀都承认了蜀帝的公孙。
揭秘:刘秀是如何收服流寇般的十万赤眉军的？