为了更有效地处理国务事务，建文于8月1日（1402年），朱迪命令金和黄淮进入文渊阁，并提前办理机务。然后将内阁扩大到七个人。从那时起，内阁在明朝政治中发挥了越来越重要的作用，甚至在清朝也使用了这一制度。
另一方面，由于朱迪造反称帝，对大臣产生了怀疑，他恢复了洪武年间废除的锦衣卫，重新开始实施明朝的特务统治。随后，在18年（1420年）的永乐，朱迪成立了东厂，使亲信太监掌权，加强特务统治，提高宦官地位。在明朝，特务统治几乎贯穿始终，成为一大特色。
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在靖难之战中，京中宦官提供的情报帮助成祖打败惠帝，成祖即位后，改变了太祖以来禁止宦官干政的政策，开始重用宦官。一方面，明朝出现了郑和等待名誉的优秀宦官，下西洋宣扬国威；另一方面，由于司礼监、东厂等宦官掌权部门地位的提高，宦官负责地方镇守、监督采购等重要工作(不全是朱迪设置的)，为今后宦官灾国埋下了种子。
1、继续实施诸侯政策：明太祖在加强专制主义中央集权政治的同时，还将他的24个儿子和一个儿子从孙子孙女分封在全国各地。一部分授予兵权，命令他们驻守北方，抵御蒙古；另一部分驻扎在大陆各省，监督当地官员。在诸王中，以北方诸王的力量最大。为避免权臣擅政，明太祖还规定诸王有权移文中央要求奸臣和举兵请君侧。这一分封制度与专制主义中央集权政治背道而驰，必然导致割据局面。
明太祖去世，太孙朱允炆(即建文帝)继位，鉴于北方诸王势力过大，决定采取削藩的方法。他们打算先废掉一些力量较小的藩王，然后再和拥重兵的燕王朱迪在一起。建文元年(1399年)，朱迪以入京杀奸臣的名义向南京进兵，于是明统治集团内部的斗争演变成了武装冲突，这就是“靖难之战”。经过四年的战争，燕王迪打败了建文帝，夺取了明朝的政权，建元永乐为明成祖。
成祖继续实施削藩政策，先后将被封在北方的诸王迁往南方，有的被废为普通人。从那时起，分裂和分裂的力量被削弱，军政权力再次集中在皇帝身上。
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2、内阁正式设立：明成祖对中央行政机关进一步调整，内阁正式设立。内阁成员由皇帝亲自从官僚中挑选，有五七个官僚，作为皇帝的顾问，在皇帝的指挥下协助处理政治事务。根据规定，其产品秩序不得超过五种产品，且不置官属，无专制诸司之权，诸司也无需向其汇报政务。但他们朝夕侍内，接近皇帝，他们的意见和建议对皇帝的决策有重要影响。这是废除丞相后加强皇权的又一次改革。
3、重用宦官:明成祖重用司礼监狱宦官宫，赋予宦官“出使、特征、监军、分镇、刺宫隐事”等权力。当时宦官与内阁权力竞争，重大政务最终取决于皇帝，皇权进一步巩固。
4、增设特务机构东厂:洪武十五年(1382年)，明朝政府在南京设立了一个叫金衣卫的军事机构，保卫皇帝，从事侦缉活动。在永乐18年(1420年)，由皇帝信任的宦官统领的“东厂”再次成立。锦衣卫与东厂合称“工厂、卫”。在南北两京，工厂和卫专门搜索所谓的“妖人”、“叛逆”和“大奸恶”在工厂和卫生中都有专门的监狱和法庭。工厂、卫生是极端专制主义中央集权政治的产物，其出现也标志着君主专制统治的加强。
明朝历史上靖难之战后如何强化集权统治？