由于郑贵妃深受明神宗的喜爱，神宗也非常喜欢她的孩子。
子
朱常洵
神宗第三子朱常迅出生于万历十四年正月初五。明神宗非常爱他。他多次想废除公主的长子，改立朱常迅，遭到大臣们的强烈反对。因此，神宗荒废朝政以示抗议。终于在万历二十九年(1601年)神宗让步，立皇长子朱常洛为王子，朱常迅为福王。3月24日，万历四十二年(公元1614年)，全家迁往洛阳大厦。福王从移居洛阳到死亡，在洛阳生活了28年。1641年正月21日被李自成杀害。崇祯皇帝赐予“忠”之称。
王享年五十六岁。崇祯皇帝辍朝三日，祭葬优于其他藩王。所有的葬礼都比其他藩王厚。崇祯十六年(1643年)正月初八日葬在莽山之原。
朱常治
朱常治(1587-1588)，明神宗第四子，母恭恪皇妃郑氏。万历十五年九月乙未(1587年10月10日)中午出生，万历十六年七月乙丑(1588年9月5日)寅时仅两岁。万历年间被封为元怀王。
女
朱轩姝
云和公主(1584-1590年)，名朱轩舒，明神宗次女，母亲为郑贵妃。公主出生于万历十一年十一月乙思(1584年1月9日)。明神宗非常高兴，奖励了内阁的辅臣，带着光禄寺银十万两举行了庆祝活动，并将母亲郑从德妃升为贵妃。辛酉，万历十七年十一月，云和公主病逝，年满六岁，后与静乐公主、云梦公主、仙居公主、灵丘公主四个异母妹妹一起葬在金山。
朱轩媁
寿宁公主，万历二十年( 1592年)三月出生，本名朱轩，明神宗第七女，明恭宗同母妹妹。万历二十七年，公主嫁给了冉兴让。明神宗非常爱这个女儿，命他每五天来朝廷，礼物远胜于其他女儿。崇祯末年，洛阳失守，明思宗命徐冉兴与王裕民、事中叶高标向河北慰问福王世子(即后来的南明弘光帝)。寿宁公主在崇祯十六年去世，年六十岁。明朝灭亡时，徐冉兴被大顺军逮捕，严刑拷打，公主遗产全部没收，徐冉兴悲愤自杀。
《明史》：主是神宗所爱的，五天一来朝，恩泽异他主。崇祯时，洛阳失守，庄烈帝(崇祯皇帝)命令与太监王裕民同行，并在河北高标安慰世子(朱由松)。都城陷，兴让死于贼。
由于郑贵妃深受明神宗的喜爱，神宗也非常喜欢她的孩子。
子
朱常洵
神宗第三子朱常迅出生于万历十四年正月初五。明神宗非常爱他。他多次想废除公主的长子，改立朱常迅，遭到大臣们的强烈反对。因此，神宗荒废朝政以示抗议。终于在万历二十九年(1601年)神宗让步，立皇长子朱常洛为王子，朱常迅为福王。3月24日，万历四十二年(公元1614年)，全家迁往洛阳大厦。福王从移居洛阳到死亡，在洛阳生活了28年。1641年正月21日被李自成杀害。崇祯皇帝赐予“忠”之称。
王享年五十六岁。崇祯皇帝辍朝三日，祭葬优于其他藩王。所有的葬礼都比其他藩王厚。崇祯十六年(1643年)正月初八日葬在莽山之原。
朱常治
朱常治(1587-1588)，明神宗第四子，母恭恪皇妃郑氏。万历十五年九月乙未(1587年10月10日)中午出生，万历十六年七月乙丑(1588年9月5日)寅时仅两岁。万历年间被封为元怀王。
女
朱轩姝
云和公主(1584-1590年)，名朱轩舒，明神宗次女，母亲为郑贵妃。公主出生于万历十一年十一月乙思(1584年1月9日)。明神宗非常高兴，奖励了内阁的辅臣，带着光禄寺银十万两举行了庆祝活动，并将母亲郑从德妃升为贵妃。万历十七年十一月，云和公主生病了。她六岁了。后来，她和四个异母妹妹一起葬在金山，分别是静乐公主、云梦公主、仙居公主和灵丘公主。
朱轩媁
寿宁公主，万历二十年( 1592年)三月出生，本名朱轩，明神宗第七女，明恭宗同母妹妹。万历二十七年，公主嫁给了冉兴让。明神宗非常爱这个女儿，命他每五天来朝廷，礼物远胜于其他女儿。崇祯末年，洛阳失守，明思宗命徐冉兴与王裕民、事中叶高标向河北慰问福王世子(即后来的南明弘光帝)。寿宁公主在崇祯十六年去世，年六十岁。明朝灭亡时，徐冉兴被大顺军逮捕，严刑拷打，公主遗产全部没收，徐冉兴悲愤自杀。
《明史》：主是神宗所爱的，五天一来朝，恩泽异他主。崇祯时，洛阳失守，庄烈帝(崇祯皇帝)命令与太监王裕民同行，并在河北高标安慰世子(朱由松)。都城陷，兴让死于贼。
万历皇帝和郑贵妃生了几个孩子？