“大黄蜂”的损失对南太平洋盟军造成了严重打击。盟军在整个太平洋战区只留下一艘严重损坏的航空母舰企业号坚持战斗。然而，经过新喀里多尼的临时修复，“企业号”仍然损坏，但两周后返回所罗门群岛南部支持盟军进行瓜达尔卡纳尔海战，在瓜达尔卡纳尔岛整体作战中发挥着重要作用。
虽然日本军队在计算船舶沉没数量方面取得了战术胜利，但日本海军舰队付出了沉重的代价。受损的航空母舰被迫返回日本进行广泛的维修和改装。修复后，“瑞丰”于1943年1月底返回特鲁克。直到1943年7月，“祥和”才回到前线。
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飞行员是日本海军最大的损失。美军在战斗中失去了26名飞行员，而日本失去了148名飞行员，包括2名俯冲轰炸机指挥官、3名鱼雷轰炸机中队指挥官和18名战斗机或其他团体指挥官。49%的日本鱼雷轰炸机、39%的俯冲轰炸机和20%的战斗机飞行员死亡。相对于珊瑚海(90)、日军在圣克鲁斯海战中失去了更多的机组人员，中途岛(110)和东所罗门(61)。圣克鲁斯战斗结束后，至少有409名日本航空母舰飞行员死于珍珠港事件。由于缺乏训练有素的机组人员，日本失去了许多机组人员，没有损坏的“瑞鹤号”和“飞鹰号”也被迫返回日本。“这场战斗在战术上取得了胜利，但在战略上却失败了，”海军中将南云人在不久的将来被解雇，并重新分配到日本海岸进行防守。考虑到敌人的工业能力有很大的优势，我们必须在每一场战斗中取得绝大多数的胜利。不幸的是，这次没有取得压倒性的胜利。”
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由于日本没有形成系统的海军飞行员培训计划和缺乏训练有素的预备役人员，经验丰富的航空母舰飞行员数量急剧下降，也没有快速的方法来取代他们。在美国失去工业力量实现目标之前，日本通过单一决定性战役打败了盟国海军航空母舰舰队的战略机遇。这导致日本航空母舰在1943年夏天回到特鲁克，没有在决定性的所罗门群岛战役中发挥进攻作用。
历史学家埃里克·哈梅尔总结了圣克鲁斯群岛战役的意义，“圣克鲁斯是日本的胜利，但它失去了赢得战争的最后希望。”
圣克鲁斯海战的评价是什么？有什么意义？