清军的主要得失之一是军事斗争和外交斗争相互合作，斗争是合理的、有利的、有节制的。面对沙俄军队对中国黑龙江流域的持续侵略和侵蚀，康熙皇帝多次与沙俄军队协商，坚决要求沙俄军队停止侵略。当外交手段无效时，他使用武力驱逐入侵者。
军事胜利后，通过外交手段巩固军事斗争的胜利成果，使捍卫领土主权的斗争合理、有利、有节制，最终使沙皇和俄罗斯不得不撤出雅克萨斯，承认中国在黑龙江流域的领土主权。由于这场斗争的性质是正义的，它得到了黑龙江流域各族人民的大力支持，军民共同，士气高昂，为战争的胜利提供了可靠的保障。
二是善于把握战机。当沙俄占领雅克萨时，正是清廷忙于平息三藩之乱，没有时间照顾他的时候，康熙帝暂时放弃了使用武力，采取了外交手段来解决这个问题。三藩平定后的第二年，康熙皇帝将以武力驱逐沙俄侵略者提上议程，并在充分准备的基础上两次出兵雅克萨，严惩入侵者。后来，卫拉特蒙古准噶尔部首领嘎尔丹发动了叛乱。为了避免双方作战，清廷及时与沙俄签署了《中俄尼布楚条约》，以结束战争，从而有精力应对嘎尔丹叛乱。
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三是善于扬长避短。清军主动扬长避短，不急于在敌炮火下发动强攻，而是在城市周围挖壕沟，切断外援，长期围困，使其炮火优势无法发挥。一年后，粮弹耗尽，90%以上的死者因饥饿、疾病和战斗而死亡。虽然沙俄侵略军选择了清朝三藩之乱的有利时机侵占雅克萨斯，并具有城市炮利等军事优势，但由于他们的战争是非正义侵略战争，他们遭到了当地人民的坚决抵制。此外，沙俄侵略军的入侵战线拉得太长，供应和后援难以保障，很快就陷入了四面楚歌的境地，失败成为其不可避免的结局。
雅克萨之战是中国清代对外战争的重大胜利。以下是大学教科书《中国古代史(下)》某版本的原文摘录:
"雅克萨反击战...
沙俄被迫同意和谈，因为沙俄军队遭受重创，守城士兵只剩下几十人，雅克萨城一夜之间就能下降。清康熙二十八年，中俄双方在尼布楚正式谈判。鉴于当时西北地区准噶尔部加尔丹与沙俄合作入侵喀尔喀蒙古，分裂叛乱势力十分猖獗，康熙指示谈判代表做出让步，以避免两线作战，集中精力平定准噶尔。俄罗斯因军事失败和远征克里米亚失败而试图保持既得侵略权益，不得不妥协。双方签署了《中俄尼布楚条约》，规定两国东部边界以格尔必齐河、外兴安岭、额尔古纳河为分界线，从法律上肯定黑龙江流域和乌苏里江流域属于中国领土，拆除雅克萨和额尔古纳河南岸的俄罗斯据点，撤出入侵军队。清初签订的中俄条约属于平等条约，具有重大的历史意义。”
对雅克萨战争的历史评价：清朝首次对外胜利