对清朝
清军平定准噶尔贵族分裂叛乱战争的胜利，不仅维护和巩固了西北边境，消灭了准噶尔贵族分裂势力，也打击了沙皇和俄罗斯侵略中国准噶尔的野心，对未来挫败帝国主义勾结利用民族败类分裂祖国的阴谋产生了良好的影响。
清军取胜，@ 清军进行了维护祖国统一、反对准部贵族分裂叛乱的正义战争，得到了包括准噶尔人在内的各族人民的支持。@ 清廷镇压抚并用的策略运用相对成功。@ 此时清廷内部稳定，国力强，军队纪律严明，战斗力强。第四，在战争指导方面，可以根据客观情况制定适当的作战政策；康熙皇帝强调，战前必须有仔细的计划和充分的准备；战斗时，根据情况和相机。为此，提出了虚自以视机宜的主张。虚己，因情应变而不固执己见。在战争中，他总是给前线将领相机处理兵事的权利，反对一切请愿。
康熙皇帝根据作战区的地理条件，认真准备战争，注重发挥骑兵快速机动作战的能力和火器部队的作用。
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对准噶尔
加尔丹的彻底失败与加尔丹在政治上树敌过多、军事上独自一人等一系列决策错误以及他与康熙皇帝和清朝作战的对手过于强大有关。最可悲的是加尔丹与俄罗斯的政治和外交实践的失败。加尔丹想利用俄罗斯的力量来实现与清朝的斗争，但它被俄罗斯利用，成为俄罗斯与清朝政府讨价还价的筹码。
此外，噶尔丹对阵的不是弱国庸才，而是国势兴旺的清朝和雄才大略的康熙帝。面对咄咄逼人的准噶尔铁骑，康熙首先在外交方面调整了正在进行的中俄尼布楚谈判政策。康熙指示，俄罗斯“如果要求尼布潮(即尼布楚)，可以以额尔古纳为界”。《中俄尼布楚条约》的签署使清政府在外交上主动出击。此外，俄罗斯政府从尼布楚条约中获利，俄罗斯最高当局远不急于与加尔丹建立联盟，而是采取口头支持和敷衍的行动政策，很快将戈洛文从西伯利亚调回莫斯科。1693年8月，俄罗斯政府还对各级监管机构发布了一项训练，禁止向卡尔梅克人输出军火。
当然，清军平定叛乱的战争持续了70年。除了强烈干预和支持叛乱者和民族关系，增加了战争的复杂性外，清军在作战指导上的一些错误也是一个重要原因（如清朝统治者对准噶尔有深深的敌意和不信任）。在沙俄的支持下，准贵族引发的民族分裂叛乱战争是一场违背各民族人民利益的不公正战争，必然遭到各民族人民的强烈反对。政治上的不受欢迎，统治集团内部的权力和利润，以及军事上许多不可克服的致命弱点，决定了其失败是不可避免的。
三征噶尔丹的相关评价:有效打击沙俄的野心