元朝衰落的主要原因是其政治黑暗、民族歧视和政治压迫政策。统治集团内部权力和利润的政治不稳定。大多数皇帝忽视国家政治，贪图享受，极度腐败。他们与部长勾心斗角，欺骗上下。朝廷横征暴敛，经济越来越衰退，引起了广大人民的反抗。地方农民起义指向元朝。元朝在历史潮流面前衰落。
元朝中期频繁更换皇帝，仅1307年(大德十一年)至1333年(元统元年)就更换了36位皇帝。全部由权臣摆弄下诏或颁布诏令。皇帝成了傀儡，无法决定重大事件。宫廷纠纷不断，欺诈时有发生。再加上经济落后，广大人民处于水深火热之中，中原农民尤其悲惨，饥寒交迫，其严重程度已达到再也无法忍受的程度。这样，人民群众被迫反抗，农民举行起义，提出“驱逐胡俘，恢复中国，立纲陈纪，救济斯民”的口号，指向元朝。
元末妥欢帖睦尔在位较长。从1333年(元统元年)6月到1368年(至正28年)7月，他已经35年了，正处于农民起义军进攻与元朝军抗击的时期。然而，在这么长一段时间内，元军的失败并不是因为将军无能，士兵不勇敢，而是因为元朝的政权不修复政治，不繁荣经济，无休止的内部权力和利润，相互残杀。特别是顺帝是个昏君，朝令夕变，出尔反尔，不能从臣之心。@ 宋王和地方势力首领在关键时刻拒绝帝诏，不派兵参战，造成四分五裂。无论哪个朝代，其被灭亡的帮派无非是朝廷的腐败，群臣之间争权夺利，相互残杀，君主之昏庸。这也可以说是国家灭亡的基本规律。
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元朝战略上麻木不仁，没有进行有组织的反击。当中原各地的农民组织起义，反对元朝时，朝廷仍然存在内部纠纷，欺骗，沉迷于酒，听不到外界的动荡，更不用说预料到起义军会埋葬元朝了。即使在当地农民起义军称帝称王的时候，朝廷也没有对策，也不能采取战略措施，只是零星下诏，与当地军队作斗争或镇压。战役中，各地元军没有计划有组织地进行联合作战，而是各自为战，如查罕帖木儿、李思齐各据一方，互不联合。后来，他们为相互争夺领土而战；秃头坚持木儿军不仅没有联合扩张木儿作战，而且两次进入首都；漠北之阳翟王阿鲁浑帖木儿不受君命，也有夺取顺帝地位的野心，这证明了元军的弱势和国家的衰落已经不远了。元朝未能及时抓住农民起义军的低潮，组织反击；战略上推动了机遇。
1354年9月(至正十四年月日)，脱脱率领号称百万军队，11月被高邮城包围。张士诚非常危急，将投降。顺帝突然下令免除百万军队的指挥权，使张士诚能够转危为安。这是元廷的大错误，结果是百万军队崩溃，元军受到严重挫伤，而来自世界各地的农民军从低潮转向高潮。
元军推进战略反击的另一个时机是，1363年春天（23年），大宋林儿，福通的失败和起义军互相攻击。例如，在23年春天，张士成杀死了刘福通，大宋红巾军队死亡；秋天，朱元璋杀死了陈友谅，天空和汉朝的一系列红巾军队死亡。就在这时，元军未能组织对朱元璋部的反击，但元朝却发生了军阀混战和宗王之争。结果，元朝给了朱元璋北上灭亡的好机会和有利条件。
一般来说，元朝迅速灭亡的原因是：一是拒绝汉文化；二是拒绝民族融合；三是腐败。
元朝中期更换皇帝频繁:20多年内更换36个皇帝