成化时期，许多幸运恶棍混入朝中，李孜省以方术和房中术献出皇帝，然后与太监梁芳勾结，打击忠臣，支持朋友党。明孝宗即位后立即逮捕了两人，使文武百官感到高兴。然后，明孝宗开始整顿官制，取代成化朝所有通过贿赂发财的官员。改革从内阁开始，罢免了以外戚万安为首的“纸糊三阁老”。万安遇事时除了喊“万岁”外，没有任何主张，明孝宗罢免他后不久，与万安混日子的尹直也黯然离职回乡，只留下刘吉。明孝宗可以看出，刘吉除了混事，还会干事，接替内阁首辅刘吉，在弘治年间一反常态，不仅经常建议国事，而且对工作极其负责。特别是西北地区的哈密战争在他的统筹规划下得到了成功的解决。
明孝宗还罢免了大量的“传奉官”，明宪宗时期得宠的众多僧道门也被赶走，少数罪大恶极，依法处罚。比如成化时期的和尚继晓，因为依靠明宪宗的宠信，作恶多端，于弘治元年被斩首示众。洪治初政，斥贤用贤，给成化后期混乱的朝廷打了一针兴奋剂，使明朝有了中兴的希望。后来去掉了李光，李光，一个部长。明孝宗对文臣极为敬重，尤其是对待王恕等老臣，以及谢迁、刘健、李东阳等阁臣，更是体贴备至。
明孝宗在清理了许多混日子的大臣的同时，使用了大量正直贤能的人。象王恕、怀恩、马文升等在成化朝因直言被贬的官员；徐溥、刘健、谢迁、李东阳等贤臣。为谦建靖功祠，使朝中和宫中都为之一新，时称朝序清宁。[明孝宗登基后立即召回王恕。王恕上任后，没有辜负明孝宗的期望。在他的主持下，他进行了官方调查，调查标准极其严格：不仅要追查经济问题，还要罢免那些身体不健康、不能胜任工作的人。仅弘治元年(1488年)就有100多名官员从中央到地方经过官员调查后被罢免。和王恕一样，马文升也在部队进行了整顿。除罢免大量不合格武馆外，还清理屯田，整顿地方武备，明军战斗力一度焕然振作。
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正是在王恕和马文升的大力行动下，一批基层懒惰官员被清除，许多才华横溢的官员得到了提拔。
鉴于前朝宦官专权乱政的教训，明孝宗严格控制宦官，东厂、锦衣卫不敢任意行事，只能奉守自己的职责。因此，几位锦衣卫的指挥官大致可以公平、公平地使用刑罚。这是明中后期其他朝代罕见的现象。对宦官的限制，执之最厉害的不止刘大夏。谢迁也曾说过内府宦官索贿，明孝宗令写旨禁约时，谢迁说：“虚言设禁，无益也。曹司必须搜查弊端，明白开奏，然后严格禁止，犯罪必须受到惩罚，普通人被困在苏。因此，诸内府宿弊，多有革除。很少有人因此而嫉妒。虽然刘大夏不是阁臣，但明孝宗对他的依赖并不局限于兵部，至关重要。
洪治中兴时期，留下了一系列忠臣、直臣。比如李东阳、谢迁等。在明武宗时期，刘瑾的乱政在前期起到了一定的遏制作用。明孝宗勤于政治事务。同时，他重新开始了盛宴，并向大臣们咨询了治理国家的方法。他还开辟了文华殿议政，利用早、午的业余时间与内阁讨论政治事务。
弘治中兴的政策:清除马臣重用贤能限制宦官