朱由检似乎对内城的衰落表示怀疑。他带领心腹太监王承恩跑到煤山（景山），环顾四周。然而，当他看到篝火烛天时，他回到乾清宫安排紧急善后事宜。他命令家人在殉难前先殉难。
他对周皇后说:大势已去。作为一个“母爱世界”的人，你应该选择光彩夺目的死亡。周皇后伤心地哭了，说:妾跟着陛下十八年，今天一起死在国内，死而无怨无悔。他们泪流满面，相对无语。
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然后，他想左右侍从，把命令传给妃嫔和易安太后（天启皇后），命令他们自杀，不要破坏祖父的国体。然后命令：传主来了。所谓“主儿”，就是他的三个儿子——王子、定王和永王。
三个儿子来了。他要求宫女带上旧衣服，亲自给他们换上，系上外套和腰带，并警告他们：你今天是王子和王子。城市破裂后，你将是一个小人物。分开逃跑！不要怀念我，我一定要为国而死，否则我不会在地下看到祖先。你必须小心，如果你遇到一个官员，老人，年轻人；如果你遇到一个平民，老父亲，年轻的兄弟；文人叫绅士，军人叫长官。然后解释一下:万一不死，以后不要忘记为父母报仇，也不要忘记我今天的警告。这是他作为父亲对儿子的临终委托，在深宫长大，不了解外界世俗民情的王子，如何在这个乱世安定下来。父子关系流露出无限的情感，终于在临别时爆发，大声嚎叫：你们三个为什么不幸出生在我家！说完后，他毫无顾忌地哭了起来，左右侍从都被生死情景感动得失声痛哭。
告别三个儿子后，周皇后痛哭着回到坤宁宫。朱由检看着太监带着三个儿子出宫，急忙来到坤宁宫，看见周皇后已上吊自杀，连声说：好！好!十六岁的长平公主(朱由检的长女)在一旁悲伤地哭泣。这样一个婷婷玉立的花季女孩落入敌人手中，后果不堪设想；但我不忍让她自杀。朱由检不得不自己动手，结束了她的生命。叹了口气，对她说：你为什么生在我家？趁她不备，拔剑砍她，公主本能地用胳膊挡住了她，胳膊被砍断了，血流如注，立刻晕倒了。
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农民军进入紫禁城后，以为她已经死了，就把她带到爷爷周奎家做饭。没想到五天后，她醒了。顺治二年，长平公主要求出家为尼，清朝当局未经批准，要求她与朱由检选定的徐都尉周世秀结婚。第二年，她因为想念父母，过度悲伤，吐血而死，年仅十八岁。松江人张晨深受感动，写了一篇《长平公主》，用优雅的文字哀悼这位不幸的公主。
但朱由检从坤宁宫赶往南宫(仁寿殿)，命令宫女动员易安太后张氏自吊，便匆匆离去。张太后不知道外界的情况，也没有上吊。第二天凌晨，宫女吵闹，慌乱不堪。张知道大事不好，便悬梁自尽。宫女救了她，送她到侧室休息。几个小时后，张氏在侧室自吊。农民军首先进入宫殿，砍断绳子，张逐渐醒来。这时，农民军将领李岩进来了，他一直敬佩太后，命令士兵不要侮辱她。那天晚上，张平静地上吊了。后来，清朝当局把她埋在西宗的德陵。
朱由检从张太后那里出来，已经是深夜了。留给自己的时间不多了。他必须尽快为自己安排一个光彩夺目、体面的死亡。轮到他选择去路了。他将勇敢地告别世界，告别他临朝十七年的紫禁城，告别他的“祖父”朱元璋的世界——明朝。
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然而，这种壮丽的告别，真的荒凉，悲伤，天空黑暗，寂静，没有任何旁观者和见证人。朱由检陪同主任太监王承恩来到煤山（景山），在寿星亭附近的一棵大树下上吊自杀，王承恩随后上吊自杀。他们俩在黑暗和寒冷的夜空中形影相挂，最后永远告别了熙熙攘攘的世界。
这是一个值得历史铭记的重要时刻，即崇祯十七年(1644)3月18日后半夜，也就是十九日(午夜一点左右)。
野史秘闻：朱由检自杀前为什么要找自己的女眷殉葬？