从时间上看，米诺斯文明应该早于迈锡尼文明，青铜器已经在公元前3000年开始使用，文明达到了相当高的水平。但在接下来的一段时间里，米诺斯文明突然消失，取而代之的是迈锡尼文明。考古发掘表明，米诺斯文明很可能是一场巨大的火山喷发而结束的。许多米诺斯艺术作品都表现出了对自然的敬畏，包括火山和大海。古生物样本表明，在米诺斯文明的最后阶段，有一场类似核冬季的灾难。米诺斯的文明很可能被地震摧毁，剩余的饥荒消亡。迈锡尼人可能出现在米诺斯文明的最低谷，并立即用武力征服了米诺斯。从迈锡尼人登陆后建造的许多城墙、加固工事和剑鞘中，我们可以看到迈锡尼人是一个比米诺斯人更好斗的外向民族。推测这种战斗应该不止于克里特岛，迈锡尼人的战斗范围可能会蔓延到整个爱琴海。米诺斯人奠定了希腊文明的基调，创造性地使用了线性a，迈锡尼人消灭了米诺斯人，占领了克里特岛。开始使用线性b。并开始向外发散，将克里特文明传遍爱琴海。爱琴海文明吸收了克里特文明和文字，进一步创造了更具影响力的希腊文明，但保留了许多文化特征，如武术、斗争、自然崇拜、多神（女神崇拜）等。
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但这并不意味着两者之间没有联系。米诺斯和迈锡尼人的遗传背景相当相似，四分之三以上的祖先都是新石器时代早期的小亚细亚和爱琴海农民。然而，迈锡尼人有来自东欧和西伯利亚狩猎采集者的血缘关系，而米诺斯人没有。这一证据支持迈锡尼人和米诺斯人的遗传连续性。本文进一步讨论了迈锡尼人与亚欧大陆人的基因融合过程。
米诺斯实际上是迈锡尼和希腊人的一些祖先。虽然他们的文明遗产有一定的联系，但它们基本上属于两个独立的文明体系，相互差异很大。
米诺斯文明和迈锡尼文明的关系？是相互传承还是独立？