十七世纪中叶，中国正处于政治极度动荡的时代。1644年3月，农民领袖李自成率领起义军进入北京，推翻了明朝。五月，白山黑水之间的清攻入山海关，赶走了李自成。从此，建立了中国历史上最后一个封建王朝。在接下来的100多年里，清朝历经顺治、康熙、雍正、乾隆四帝。前清不仅摧毁了明朝的农民起义和残余势力，还平息了吴三桂的叛乱，统一了台湾。清朝的一系列政策措施逐步恢复了战争破坏的社会经济，中国也进入了稳定发展的新时期。
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与此同时，新疆也处于你我争夺的封建分离状态。首先，蒙古调也喇警部称霸西北强盛时期，在首领死后沉默了一百年，终于恢复了活力，继续活跃在西北广阔的草原上。
蒙古的准噶尔部在清军入关的同时逐渐强大起来。在首领巴图尔浑台吉的带领下，准噶尔部逐渐取代了卫拉特蒙古和硕特部，成为各部落的首领。准噶尔部不仅迫使土尔胡特部和卫拉特蒙古和硕特部的主要部落迁往其他地方，还击败了周围的哈萨克人和柯尔克孜人，统治着北起额尔齐斯河和鄂毕河的中游，南至天山，包括巴尔喀什湖以东以南的广大地区，成为中国西部地区强大的地方政权。
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1665年(清康熙四年)，巴图尔珲台吉去世，儿子僧格继位。1671年，僧格被同父异母兄弟策臣汗和巴图鲁杀害。不久，策臣汗和巴图鲁又被他们的部门杀死了。在这种群龙无首的情况下，巴图尔珲台吉的另一个儿子和尚格的弟弟加尔丹从西藏回来夺取政权。从塔尔巴哈台(今塔城)和布克赛尔到伊犁河谷的准噶尔部大本营。在击败了一些准备好的政敌后，他逐渐巩固了自己的统治地位。1679年，噶尔丹自称博硕克图汗，要求清政府承认。与此同时，噶尔丹部还派兵到哈萨克、布鲁特、诺盖等部落四处作战。1680年，噶尔丹还派出12万人越过天山南下，攻占阿克苏、乌什、喀什(今喀什)、叶羌(今莎车)等地，摧毁了叶羌汗国，获得了天山南北的统治权，使准噶尔部的统治范围覆盖了整个天山南北。1697年，加尔丹对清政府发动叛乱。战争失败后，噶尔丹去世，僧格的儿子策妄阿拉布坦继任准噶尔部首领。与反复无常的噶尔丹不同，阿拉布坦和噶尔丹策凌继续派使臣到北京，表示将继续臣属于清政府。
黑水营之战发生在什么背景下？叛乱者是谁？