一些学者认为，尼西亚帝国的统治标志着希腊民族和国家意识的兴起；但他们也指出，这种民族意识的兴起并没有影响官方的“帝国”意识形态。传统观点(拜占庭帝国是罗马帝国的继承者)并没有改变，这可以从尼西亚皇帝的子民那里改变。Rhomaioi在这个名字中可以说明。尼西亚帝国的官方意识形态是征服运动和军国主义（这些在14世纪下半叶帕列奥列格王朝的修辞中是看不到的），以君士坦丁堡的持续荣耀和恢复君堡的希望为特征，强调君士坦丁堡类似于上帝在旧约中给予选民的“应许之地”，而不是诉诸政治上的普世主义或希腊民族主义；这一时期的皇帝经常被比作摩西或所罗巴伯（巴比伦囚犯后带领犹太人回到家乡的领导人），甚至引导上帝的子民去应许之地的“火柱”，比如在尼基塔斯-侯尼亚迪斯(尼西亚帝国时期的历史学家)献给塞奥多利一世的献辞中(表现如下)。
在此期间，文字还使用旧约以外的形象来赞美帝国的复仇战争；尼基塔斯-侯尼亚迪斯将尼西亚帝国与塞尔柱苏丹的战斗描述为基督教与伊斯兰之间的战争（尽管拜占廷皇帝阿列克修斯三世在塞尔柱人参战），并将塞奥多利在塞尔柱苏丹的战斗中的伤比作为耶稣在十字架上的痛苦。Dimter
Angelov认为，西方十字军的概念已经影响了尼西亚的再征服运动，同一时期的牧首Michael IV
Autorelanos在战斗前向尼西亚军队提供了全面的赦免，这与西方十字军的全面赦免非常相似。然而，这种可能受到十字军影响的赦免行为持续了很短的时间，并在1211年后逐渐消失。
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拜占廷人在13世纪也发现了帝国(1204年后)的情况与古典希腊相似，这加强了一些学者(如A).E.Vacalopoulos)他们认为，这种类比和对拜占庭古典主义的重新评价是希腊民族主义的起源。君士坦丁堡落下后，帝国的情况被认为类似于被野蛮人包围的“希腊人”。侯尼亚迪斯将塞奥多利杀死的塞尔柱苏丹(凯库斯老一世)与薛西斯进行了比较，牧首Germanus
II
(1223–1240）约翰三世的胜利被视为另一场马拉松或萨拉米斯大捷。类似地，塞奥多利二世将父亲的胜利与亚历山大皇帝的事迹进行了比较，并赞扬了同时代“希腊人”的杰出武功。
此外，在拜占庭人的语言中，这一时期“希腊人Hellene”一词的意义似乎发生了变化。(自从基督教成为国教以来)到这个时间点(十三世纪之前)，“希腊人”一词指的是“异教”，是贬义词(源于圣经)。从尼西亚帝国时期开始，“Graikoi”和“Hellenes“进入帝国的外交语言，作为宗教和民族的自我认同形式，反映了它
与拉丁人区分帝国及其子民的殷切期望。
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牧首Gemanus
II特别论证了这一新的民族和宗教地位。他在信中将完美的背景等同于希腊血统的纯洁，强调他的希腊修辞和希腊民族背景比与君士坦丁堡的关系更重要，并鄙视那些自满地窃取君士坦丁堡的拉丁人。（现在）学者们仍在争论“希腊人”一词意义转移的确切时间，比如说
Beaton认为，12世纪“希腊人”一词的应用表明，在1204年君士坦丁堡陷落之前，这个词的意义已经被重新评估。@ 与Vacalopoulos不同，Beaton认为这一时期只存在萌芽状态(希腊)民族意识，主要是基于语言认同，不能称之为希腊民族主义。
安戈尔德，拜占廷学家(Michael
Angold)指出，这一时期帝国的意识形态变化显示了拜占庭人适应政治流亡、动荡和文化环境变化的能力。然而，在帕列奥列格的米海尔八世恢复帝国后，他放弃了大多数尼西亚帝国的意识形态发展，帝国恢复了早期的意识形态状态。
尼西亚帝国有什么样的思想文化？尼西亚帝国的民族意识是什么？