《乙思条约》缔结后，韩帝国高宗皇帝被日本人控制，韩圭高以“宫禁近在咫尺，措施不当”为由被罢免，被判处三年流放徒刑。 [16]
听说《乙思条约》缔结后，韩国人民都感到悲痛和愤慨。史料描述了当时的情况，说:“我很沮丧，成千上万的歌曲成群结队地喊道:‘国家已经死了！曹为什么以生为生？狂醉悲骂，局如无奈。烟火不举，景色惨郁，如经战。日本人派兵巡绰，以备非常，偶语诽谤，最终无法禁止，如是十月。可以看出，签署保护协议后，韩国社会一直处于悲伤和沮丧的阴影之下。人们称李完用、朴齐纯等五大臣为“乙思五贼”，要求“废除保护协议”、“杀五贼，驱逐日本海盗”，摧毁卖国贼的房屋。汉城学生罢工，商人罢工，数千名基督徒聚集在崇礼门教堂，抗议乙思勒约。有民族气节的文武官员先后攻击保护协约和乙思五贼，要求皇帝宣布条约无效。由于皇帝已经被日本控制，他们的上疏运动以失败告终。闵泳焕、赵秉世等大臣以死亡殉国。中国学生潘宗礼听到《乙思条约》的消息后也自杀了。
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《皇城新闻》主笔张志远在《乙思条约》披露后写下了题为“是日也哭”的报道，他在文章结尾写道：“呜呜！呜呼愤矣!我是二千万奴隶同胞！生乎?死乎?檀、箕以来四千年的民族精神一夜之间突然灭亡痛哉痛哉!同胞同胞!充分表达了此刻韩国人民的痛苦心情。而更多的韩国人则掀起了一场强大的反日义兵运动，武装抵抗日本的侵略。现在韩语把天气描述得很凄凉的习语是“을씨년스럽다"，本意是“乙思年似”(을씨년스럽다)，可见《乙思条约》给朝鲜民族留下了难以愈合的伤疤。
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通过这一条约，日本实现了将韩国变成其保护国的目的，使韩国成为日本事实上的殖民地。根据《乙思条约》第一条和第二条，韩国的外交权被剥夺，其对外关系被日本完全接管，未经日本许可不得与外国签订条约。第三条规定，日本设立韩国统一监管机构，控制韩国外交，实际上管理韩国的一切事务，干涉韩国内政，实际上是殖民机构，也是韩国帝国皇帝的“皇帝”。条约缔结后，韩国皇帝和政府成为日本人的傀儡。伊藤博文于1906年3月2日抵达汉城，担任韩国第一任统监，建立了统监制度。一方面，韩国利用一次会议和李完用等亲日大臣来扩大日本的影响力。另一方面，对韩国人民的反抗调到韩国，全力镇压，打破了所有的义兵。基本平息反日义兵运动花了三年多的时间。正如日本学者所讨论的，《乙思条约》签署后，“自三国干涉归还辽以来，日本一直希望统治韩国，其中大部分已经实现”。《乙思条约》可以说是《江华条约》以来日本30年努力的结果。它的签署使日本赢得了朝鲜半岛。日韩合并只是时间问题。
乙思条约德的缔结对历史有什么影响？对日本有什么好处？