隋朝成立后，根据内史崔仲方的建议，杨坚废除了北周模仿《周礼》的六官制度，建立了以尚书、门下、内史三省、尚书六部为核心的朝政机构。
正如《隋书·百官志》所说:“高祖既受命，又改周六官。他的名字大多取决于前代的方法。把三师、三公、尚书、门下、内史、秘书、内侍等省、御史、都水等台。……朝代的众务总是归于台阁。”隋朝官制最大的特点是收集东汉以来官制发展变化的巨大成就，使其规范化、固定化。
尚书省
作为官职，尚书始建于秦代，但只是少府属官。西汉武帝开始提高尚书的权力，赋予他决策的职能。到东汉光武帝时，尚书被增加为六曹，被称为尚书台，成为国家政府事务的实际中心。“选举奖励，一个是尚书，尚书任命，重于三公”。三国两晋时期，尚书台独立于少府，被称为“尚书省”，正式成为总理全国政务的最高机构，结构逐渐复杂。然而，直到南北朝末年的北齐和陈石，尚书省的下层机构和官员配置仍然不稳定和标准化。例如，陈朝的尚书省有五名尚书成员和二十一名郎官。北齐尚书省有六名尚书成员，但下辖二十八曹，其中都官尚书统辖都官、二千石、比部、水部、膳部五曹。设官数量不同，管辖权和范围也不同，差异很大。
隋代尚书省地位较高，管理全国政务。隋书百官志说：“尚书省，一切都很好”。这句话说明了尚书省在中央最高行政机构中的权力和地位。当然，这并不意味着尚书省什么都做。尚书省总官署名为尚书都省，任命尚书令，左右仆人各射一人，总领官部、礼部、兵部、都官(开皇三年改刑部)、度支(开皇三年改民部)、工部等六部。六部长官是尚书，与尚书令、左右仆合称“八座”。官部掌文官选授考课，官部尚书绞官部侍郎2人，主爵侍郎1人，司勋侍郎2人，考功侍郎1人。礼部掌学校，礼乐。礼部尚书统礼部。祠堂侍郎各1人，主客，膳食侍郎各2人。兵部掌军籍舆马，兵部尚书统兵部，职方侍郎2人，驾部1人，库部侍郎1人。都官掌管刑政司法，都官书统都官侍郎2人，刑部，比部侍郎1人，司门侍郎2人。度支掌财税出纳，度支书统领度支。户部侍郎各2人，金部、仓部侍郎各1人。工部掌工程建设，工部尚书统工部。屯田侍郎各2人，虞部、水部侍郎各1人。六部共24曹36侍郎，分司曹务，直宿禁省。尚书省长官是尚书令，其实一般都不授人，隋朝只有杨帝时的杨素有易戴之功，又平定了汉王谅，方进位尚书令。但是杨帝对他“外貌特礼，内情很薄”。虽然他生病了，但杨帝经常派名医给药，“然密问医生，永远不会死”。隋代尚书省长官实际上是左右仆射(从二品)。其中左仆射判官部、礼部、兵部，兼掌纠弹；右仆射判都官、度支、工部，兼知财政费用。仆射的属官有左右丞各一人，都事八人。杨帝把一切都拨到了六个部门，并增加了左右司郎一个人来代替。他们是唐代左右司郎的前身。隋代尚书是一个机构完整的中央政务部门，与前代大不相同。与后代的“侍郎”不同，“侍郎”掌一“司”。
中书省
汉武帝时期也设立了中书，以宦官为代表，帮助皇帝在内廷传达诏令。曹魏时期，中书省正式成立，其“掌赞诏令、记会时事、典作文书”，成为为为为皇帝起草诏令的独立机构。历两晋南北朝，“国家政事，为中书省……总国内机要，尚书只听”。形成了中书决策和尚书执行的格局。但南北朝后期北齐、北周中书省的兼职工作太多，如修国史、管理宫廷伎乐、判刑等，不利于决策的专业化。门下省来自秦朝的皇帝侍从官，汉朝作为外国官员的加官，还没有形成官署机构。曹魏时期开始称之为“侍中省”和“散骑省”，南北朝时期开始称之为“门下省”。门下省负责传达皇帝的诏令，逐渐有权封臣驳正诏令，开始形成和尚书和中书对朝政决策权三分的局面。由于门下省从汉代皇帝侍从官演变而来，到南北朝末，仍有饮食、医药、车马等服务皇帝的日常生活，其宫官性质十分强烈。如北齐门下省，下辖尚食、尚药、主衣、斋帅、殿中诸局，这些都是为皇帝服务的。到南北朝末期，虽然尚书、中书、门下三省的机构及其在朝廷决策行政体系中的地位已基本确定，但其职权的专业化和机构的标准化过程尚未最终完成。正是在这一历史演变的基础上，隋文帝进一步调整了三省制度，使其规范化。
门下省
隋初是侍奉建议机关，掌审政令，封驳一切。它的长官有纳言两人(正三品)，本来是为皇帝的顾问服务的内廷。《隋书·柳机传》载，柳机在文帝开皇年间为纳言，“当近侍，无损益，又好喝酒，不亲细务”。华州刺史很快就出来了。二级官员给黄门侍郎4人，负责纠正奏章得失。《隋书·柳雄亮传》中，雄亮任黄门侍郎时，“尚书省凡有奏事，雄亮多驳正，深为公卿所畏”。杨帝去“给事”二字，又加给事郎四人，这就是唐朝给事中的前身。@ 历史上还有6人录事和通事令。隋初还有散骑常侍，通直散骑常侍4人，建议医生7人，都是建议官。杨帝说他天性不喜人劝诫，抛弃了所有的劝诫。隋初，门下省还掌皇帝衣食供奉等日常生活事务，统城门、尚食、尚药、符玺、御府、殿内等六局。城门局:校尉2人，直长4人。尚食局：设典御2人，直长4人，食药4人。尚药局：置典御2人，侍御医，直长各4人，医师40人。傅玺、御府、殿内局：置监各2人，直长各4人。
内史省
后来改为内书省，为中枢制令机关，专门起草皇帝诏令。隋初置监，令各一人，后废监，令一人(正三品)。内书令，本称中书令，本称汉代中书记，本称“中书”。在汉武帝的时候，司马迁被腐刑出狱后，他成为了一名中书(拜访者)。魏晋以来，中书令掌出纳王命，南朝以公兼之，隋朝以专人任职。杨帝时，内书令已不常置，常以官内书侍郎为职。内书省的官员也有8人舍人，手掌起草制令；通事舍人16人，手掌奏响。然而，在隋朝，偶尔会有内书侍郎亲自起草圣旨。比如《隋书·薛道衡传》中，高祖时，薛道衡担任内书侍郎。“每次构文，都要稳定空斋，躺在墙上，闻到户外有人就生气。文帝称赞他说：“薛道衡作文书，称我意。”
秘书省
这是掌握具体事务的官署，秘书省掌握书籍藏整理。官署一般比较清闲，长官为秘书监(正三品)1人，次官有秘书丞1人。官员有秘书郎4人，校书郎12人，正字4人，录事2人，带领作曹，太史曹。修写曹掌国史，有作郎2人，佐郎8人，校书郎2人，正字各2人。太史曹掌天文历法，置太史令、太史丞、司历各两人，监候四人。隋阳帝大业年间，又新置儒林郎10人，掌明经顾问，唯诏所使。文林郎21人，掌写录文史，检讨旧事。
内侍省
是内廷的侍奉机构，隋初由宦官担任。内侍(四品)两人为其省长。二级官员有两个内侍。官员有6名内侍者，2名内侍者，12名内侍者，6名寺庙侍者，8名非侍者，领导尚食、掖庭、宫廷、奚官、内仆、内府等6场比赛。杨帝改内侍省为长秋监，有长秋令、少令、程等士人，低级使者为宦官。
以上是隋朝中枢机构的“五省”，由朝廷内外政务统辖，是中央最高执政机关。
隋朝官制：建立以尚书、门下、内史三省、尚书省六部为核心的朝政机构