蒙古在高丽置征东行省，全称征东等处行中书省，由元朝直接统治。在王京(今朝鲜开城)设立达鲁花赤，管理征东事务，监督高丽国政；保留高丽原有的政府制度，“从其国俗”、宰相由高丽国王兼任“自奏选属官”。@ “高丽军民总管府”迁往辽阳省沈州，主要负责高丽侨民事务；黑龙江下游奴隶“征东诏讨论”负责骨尾*、吉里迷等族事务；位于延罗岛的“延罗军民总管府”负责防日和高丽海侨民事务。元朝直接统治的“高丽军民总管府”、“征东诏讨司”、“延罗军民总管府”都有参考政治管理。
到11年5月（1274年），忽必烈将女儿忽都鲁杰丽米斯嫁给了高丽王子。6月，高丽老王去世，王子继位。第二年，应忽必烈的要求，高丽新国王改变了所有类似元朝的省、医院、台湾、部门的官方名称，并派出20名贵族儿童“服务”元朝。
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至元十七年(1280年)夏，元朝在高丽创建驿站，加封高丽王储为开府仪同三司、行省左丞相。第二年，元朝在高丽征发了2.5万名士兵和水手，900艘战舰参加了侵日战争。高丽人民不堪其扰。至元十九年(1282年)，日本侵扰高丽沿海，在高丽国王的要求下，元军驻扎在金州。第二年，元朝正式在高丽设立征东行中书省，以高丽王和元军将领阿塔海为代表。至元二十一年(1284年)，忽必烈将耽罗归高丽。
大德三年(1299年)，元成宗铁穆耳大帝命富里吉思为高丽征东行省平章事。因为富里吉思对高丽内政的横向干预，引起了高丽人民的极大愤慨。1301年，成宗被迫撤销省级建设。然而，直到元末，高丽的内政和外交都受到元朝的控制。
1280年，为了进攻日本，元朝在朝鲜半岛设立了征东行省，并派遣“达鲁花赤”在高丽首都控制高丽国政。高丽国王只能住在江华岛。1281年，随着日本进攻失败，征东行省一度解散。1287年，征东行省复设，高丽王兼任征东行省达鲁花赤，成为元朝的藩属国。直到1356年恭王回复，高丽朝廷才重新掌握统治权。
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自从高丽元宗的世子忠烈王娶了忽必烈的女儿为妻后，高丽君主直到高丽恭王娶了蒙古公主为妻。根据协议，高丽君主的继承人必须在元大多以蒙古人的形式长大后才能回到高丽。
此后，高丽在蒙古殖民统治下生活了近百年。
后续高丽蒙古战争怎么样？蒙古统治高丽多久？