朱元璋是历史上有才华的皇帝。为了保证封建统治的长期稳定，明太祖年实行了分封制度。在腹部和边境地区，24个儿子和一个孙子被授予国王称号。他们被要求主持军事事务，平息边境纠纷。所有封建诸侯都在封建领土上设立了宫殿和官员，并命令“少3000名卫兵，多1900名士兵”。
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然而，他害怕诸侯势力扩张对中央集权的威胁。神父藩王“只分等级，不分人民，不分诸侯，不分领土”。诸王尚幼在最初的分离中也起到了稳定边界的作用。但随着年龄的增长和权力的增强，他们开始突破这些限制。尤其是燕王朱棣，拥兵10万人，宁王朱权镇守大宁，“盔甲18万，皮车6000辆”，成为对抗中央政府的分裂势力。早在1376年(洪武九年)之前，山西平遥就训练叶伯巨书明太祖，并以西汉的“七国之乱”和“西晋八王之乱”为警告。然而，阴太祖并没有听取建议，而是以“断了我的骨肉”的罪名处决了叶伯巨。
1392年(洪武二十五年)，朱标王子去世，明太祖按照长子继承制，让朱标儿子朱允文成为皇位继承人。71岁的明太祖死于1398年(洪武31年)，朱允炆登基，被称为建文帝。他以集权为首要任务，实行消藩政策，向东方官大臣齐泰作军事报告，辅以教师黄子澄为太常寺卿，参加军事工作。当时北方大部分诸侯都有重兵，守卫的边将都服从了他们的约束。特别是燕王朱棣，不仅有10万人的兵力，而且“智勇双全”，早已有了雄心壮志。皇宫制造秘密武器，私印玉玺，征兵买马。继位后，朱允炆与齐泰、黄子澄进行了讨论。燕王是强大的，他决定先切断燕王的手脚，削弱较弱的藩王，然后消灭燕王。洪武三十一年七月，削周王。因为周王是燕王的同母兄弟，而朱允炆怕他和燕王哈成一气，所以决定先废周王。周王次子朱有，于是派曹国公李景隆以备边的名义经过开封，将周王全家押回南京，废为普通人，迁往云南蒙化
(今云南巍山)。
建文元年(1399年)4月，切齐、湘、代三位亲王，废为普通人。湘王不堪受辱，为保名节自焚；齐王在南京被软禁；代王在封地大同被软禁
。两个月后，岷王被废为普通人，迁徙到漳州 。
朱迪是明太祖的第四个儿子。他长期守卫北平。在保卫边境战争中，他取得了非凡的成就。1399年（建文元年），他利用朝贺改元的机会亲自前往南京，密切关注虚实，寻求对策。回到北平后，他假装病得很重，卧床不起，但事实上，他聚集了自己的力量，积极准备夺取王位。
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燕王朱迪起兵造反，援引《皇明祖训》，号称清君侧，指国君周围的齐泰和黄子澄为奸臣(谋杀皇室亲属)，需要根除，称自己的行为是为国家服务靖难(意为平定国难)，并在惠帝朱允炆上书。明建文帝派耿炳文、李景隆先后率领北伐军，均被朱棣靖难军击败。靖难军很快占据了河北的大部分地区，但进入山东后，他们遇到了盛庸、铁弦等部门的顽强抵抗。经过三年的反复斗争，朱迪在1404年（建文四年）攻占扬州，击败长江守军，进入南京，建文帝下落不明。齐泰、黄子澄、方孝儒被处死。这场战争在历史上被称为“靖难之战”。
燕王朱迪成为皇帝，改元永乐元年，称明成祖。继续加强封建专制统治，他采取了一系列措施。@ 继续消藩。明成祖被封王夺地，深感支兵自重的封王威胁中央政权，继续实行消藩政策，使封邑王成为食衣税的寄生虫，进一步集中军事力量在皇帝手中。终明一朝，虽然有一两个诸侯王分裂，但并没有导致国家分裂。二是建立内阁。明成祖即位初期，翰林院解缙等大学士被允许协助皇帝处理政治事务，提高文官地位。在内务宫的处午门内，被称为内阁。内阁有5到7名大学士学位，但他们的地位非常重要。内阁没有官僚或绝对官员，也没有决策权。重大事务仍由皇帝决定。@ 将首都迁往北京。北平原是明成祖的主要土地。
靖难之战后，明成祖继续削减藩王，这样，北方边疆的防御系统就空了。明成祖决定迁都，以有效控制北方。1408年(永乐元)，北平改为北京。北京和大运河的大规模建设始于1406年(永乐四年)。明成祖从全国招募了20万名工匠和100万役夫，历时15年，建成了具有世界视野的壮丽北京城。1421年(永乐19年)，明成祖搬迁北京，将南京改为留都，所有机构仍设立。此后，北京成为明朝的政治、军事、经济和文化中心。明成祖迁都北京有利于抗击北方蒙古贵族的入侵，控制东北地区，对进一步巩固北方边防，维护民族团结具有积极意义。
明太祖实行分封制，但结果适得其反