很多人说太平天国的内斗是萧朝贵冯云山死后才注定的。事实上，即使萧朝贵冯云山还活着，这件事怎么看？事实上，从杨秀清金田起义前的一次疾病可以看出。
《天情道理书》记载:“追庚戌四月，东王一旦突然口哑耳聋，耳孔浓(脓)，眼睛流水，苦不堪言；一个是因为弟弟妹妹赎病，另一个是天父默默做的。杨秀清病重，萧朝贵开始代表“首辅”，掌管上帝会的教务和教权。这也是他超越杨秀清的好时机，萧和杨斗争的暗流随之涌现。
在萧朝贵主政期间，杨秀清采取了三种打击和控制措施：
第一，直接命令。道光30年(1850年)8月初一，萧朝贵在平南鹏化山约杨秀清战妖完成，直接下令:“四哥，二先回去。弟弟现在停了几天，先制服妖魔，然后回来。”杨秀清奉天哥的命令从鹏心山到鹏化山战妖，然后奉萧朝贵的命令先回来。可见萧朝贵已经能够直接命令和控制杨秀清的行动。
第二，诽谤和诽谤。在杨秀清病重期间，上帝会议“不知道皇帝的圣心，都私下讨论了东王几成病废，以至于他不知道如何尊重东王，而是包读东王”。杨秀清的名声受到了极大的损害。这种舆论导向只能由萧朝贵来做，这种舆论只有在萧朝贵的默许下才有生存的空间。
三是孤立压制。8月20日，杨秀清病重期间，魏昌辉奉洪秀全的命，想接杨去花洲养病。天哥立即拒绝了，然后“魏正要求天哥去金田安福，去蓝厂安福”。萧朝贵总是“不去”，“不去”。、“总不妨”等话拒绝放人。显然，萧朝贵拒绝杨秀清脱离自己的主要原因是为了孤立和控制杨秀清，杜绝杨秀清与洪秀全、冯云山和当地实力派的联合，确保金田作为上帝协会的大本营和指挥中心。
拒绝放人后，萧朝贵预感到自己的首辅地位并不稳定，而自己手中的权力也许迟早会还给还在生病的杨秀清。他代天哥传言给韦昌辉：“联这今假或三两月下一次也不确定。有事尔同尔姐夫商量理酌，切不好界人看小尔三星兄江山。联合会命令说话，尔切要记住。“在萧朝贵对韦昌辉的千言万语中，我们不难看出他对权力的怀旧，他能依靠的主要是韦昌辉。萧朝贵的预感可能是对的，杨秀清一个月后复出，天父复出三四个月后，天兄不得不保持沉默。
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在金田团营即将完成的重要时刻，杨秀清病愈登场，对他来说，是再次立天父权和自己威严的好机会。杨秀清复出后，“有神附体传闻，比别人多。每次代天父上帝传言，严厉肃穆，责人罪恶，常指个人宣传其丑行。彼此劝人为善，预言未来，或者号令人该怎么做”，“每一句话都是实现的”。杨秀清要通过天父的频繁出现，消除萧朝贵执政时期带来的一系列负面影响。
10月初一，金田集团营还没有完成。贵县石达开部于8月中旬到达金田，象州石龙村谭也带领公众到达，但陆川、博白、华州、信义等地方仍在路上，9月15日兄弟仍强调：“祈祷秘密，不出名，现在不拉旗，恐怕很多兄弟不能团聚。”
直到9月，萧朝贵仍然坚持保守的态度，暂时不起事。10月初一，杨秀清复出，否认萧朝贵的保守政策，果断采取措施迎接公众，毫不犹豫地与清军交火，大张旗鼓地准备起事。10月18日，杨秀清派队迎接来到大洋营的陆川上帝。他将依靠九个部门与清军作战。赖九个部门成功地从上游渡过河，抵达金田。
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11月22日，杨秀清派蒙得恩带人去花洲。24日，他在思旺击败得州协会副会长李殿元部，杀死秦川检查张铺，欢迎洪秀全和冯云山返回金田。花洲上帝的会众也来到了金田。这就是著名的“迎主之战”。洪秀全和冯云山在8月份努力与杨秀清见面，但由于萧朝贵的阻碍，他们未能成行。这一次，三人终于相遇了，不是在花洲，而是在金田。洪、杨、冯的再次会面点燃了金田起义的火种，也宣布萧朝贵超越杨秀清的尝试失败。这也表明，即使萧朝贵不死，他也很可能与杨秀清发生冲突。太平天国内斗的命运早已注定。
萧朝贵主政期间，为控制杨秀清采取了哪些措施？