爱奥尼亚起义，以及伊朗、多丽丝、塞浦路斯和加勒比的起义，是希腊反对波斯统治的军事叛乱，从公元前499年持续到公元前493年。叛乱的核心是小亚细亚希腊城市对波斯指定统治他们的暴君的不满，以及两个米利西安暴君、组氨酸和阿里斯蒂格勒的个人行为。公元前540年左右，爱奥尼亚的城市被波斯征服，后来被土豪统治，土豪由波斯总督在萨尔迪斯提名。公元前499年，米利都暴君阿里斯塔戈拉斯与波斯太守阿尔塔费伦联合远征，试图征服纳索斯，巩固他的地位。阿里斯达戈拉斯意识到他即将被推翻为暴君，他选择煽动整个爱奥尼亚反叛波斯国王大流士大帝。
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在雅典和埃雷特里亚军队的支持下，爱奥尼亚人在公元前498年继续前进，占领并烧毁了萨尔迪斯。然而，在回到爱奥尼亚的路上，波斯军队跟随他们，在以弗所战役中被决定性地击败。这场战斗是爱奥尼亚人唯一的进攻行动，他们随后采取了防守。波斯人在公元前497年采取了三管齐下的进攻，旨在恢复叛乱的外围地区，但叛乱蔓延到卡里亚意味着达乌苏人统治下的最大军队重新部署到那里。这支军队最初在卡里亚成功作战，但在Pedasus战役中被伏击并被歼灭。这导致了公元前496年和公元前495年剩余时间的僵局。
公元前494年，波斯陆军和海军重新集结，直接进入米利都叛乱的中心。爱奥尼亚舰队试图从海上保卫米利都，但在萨米安人叛逃后，他们在莱德战役中被决定性地击败。米利被围困，被俘，人口由波斯人统治。这一双重失败有效地结束了起义，加勒比人向波斯人投降。公元前493年，波斯人减少了西海岸仍然反对他们的城市，最终在爱奥尼亚增加了和平解决方案，这通常被认为是公平和公平的。爱奥尼亚起义是希腊和波斯帝国之间的第一次重大冲突，也是希腊和波斯战争的第一阶段。尽管小亚细亚已经回到波斯阵营，但大流士发誓要惩罚雅典和埃雷特里亚的支持起义。@ 希罗多德认为，希腊无数的城邦对其帝国的稳定构成了持续的威胁，因此大流士决定征服整个希腊。作为爱奥尼亚起义的直接结果，希腊的第一次波斯入侵始于公元前492年，希腊波斯战争的下一阶段。
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事实上，爱奥尼亚起义的唯一主要来源是希腊历史学家希罗多德。被称为“历史之父”的希罗多德，出生于公元前484年，小亚细亚的哈利卡纳苏斯(当时波斯人统治)。他写了他的“调查”(希腊文-历史)；大约在公元前440-430年，英国-(历史)试图追溯希腊-波斯战争的起源，这仍然是一段相对较新的历史(战争最终结束于公元前450年)。至少从西方社会的角度来看，希罗多德的方法是完全新颖的，他似乎发明了我们所知道的“历史”。正如荷兰所说：“第一次，一位编年史学家把自己定位在追踪冲突的根源上，而不是追溯到遥远难以置信的过去，也不是追溯到上帝的异想天开和愿望，也不是追溯到一个声称自己掌握了命运的民族，而是追溯到他可以亲自核实的解释。“
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后来，一些古代历史学家批评希罗多德，尽管他们追随希罗多德的脚步，首先是修昔底德。然而，修昔底德选择了希罗多德留下的地方来开始他的历史（当塞托斯被包围时），所以他可能认为希罗多德的历史足够准确，不需要重写或纠正。普鲁塔克在他的文章《论希罗多德的恶毒》中批评希罗多德，认为希罗多德是一个“野蛮人”，这表明希罗多德实际上可能做了一份公正合理的工作。尽管他仍然被广泛阅读，但希罗多德的负面观点已经传播到文艺复兴时期的欧洲。然而，自19世纪以来，随着民主时代的到来，他的声誉得到了戏剧性的恢复，一些考古发现一再证实了他对这一事件的看法。现代流行的观点是希罗多德在他的历史上做得很好，但他的一些具体细节（尤其是军队的数量和日期）应该受到怀疑。然而，许多历史学家仍然认为希罗多德的叙述有反波斯偏见，他的许多故事都是为了戏剧性的效果而修改的。
在迈锡尼文明崩溃后的黑暗时代，大量希腊人移居小亚细亚，定居在那里。这些定居者来自伊朗人、多里安人和爱奥尼亚人三个部落群。爱奥尼亚人定居在丽迪雅和卡里亚沿岸，建立了12个爱奥尼亚城市。这些城市是加利亚的米利都、米乌斯和普里恩；以弗所、跋、列多、特奥、克拉佐梅纳、弗卡亚和色雷斯；以及萨摩斯岛和希奥斯岛。尽管爱奥尼亚城市彼此独立，但他们承认自己有共同的遗产，有一个共同的寺庙和聚会场所，即Panionion。因此，他们形成了一个不接受其他城市甚至其他部落爱奥尼亚人的“文化联盟”。直到公元前560年被著名的吕底亚国王克罗伊斯征服，爱奥尼亚的城市才保持独立。直到吕底亚被新生的塞勒斯大帝阿契美尼德帝国征服，爱奥尼亚城市仍在吕底亚统治之下。
与利比亚人作战时，赛勒斯向爱奥尼亚人发出信息，要求他们反抗利比亚统治，但爱奥尼亚人拒绝这样做。塞勒斯征服莉迪亚后，爱奥尼亚现在提出以同样的条件成为他的臣民，就像他们曾经是克罗伊斯的臣民一样。由于爱奥尼亚人以前不愿意帮助他，赛勒斯拒绝了。因此，爱奥尼亚人准备自卫，赛勒斯派中位将军哈帕古去征服爱奥尼亚。他第一次攻击阿福卡亚；Phocaeans决定完全放弃他们的城市，流亡西西里岛，而不是波斯臣民（尽管许多人后来回来了）。当哈帕格斯攻击特奥时，一些泰亚人也选择移居国外，但其余的爱奥尼亚人仍然留在那里，反过来又被征服了。波斯人发现爱奥尼亚人很难统治。在帝国的其他地方，塞勒斯可以找到一个优秀的当地群体来帮助他统治他的新臣民，比如犹太牧师。当时希腊城市没有这样的群体；虽然通常有贵族，但不可避免地会分为相互斗争的派系。尽管这让他们卷入了爱奥尼亚人的内部冲突，但波斯人还是决定在每个爱奥尼亚城市赞助一个暴君。@ 暴君可能会形成一种必须被取代的独立倾向。暴君本人面临着一项艰巨的任务；在支持波斯人的同时，他们不得不转移同胞最大的仇恨。
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在波斯征服爱奥尼亚约40年后，米利西安暴君阿里斯蒂格勒发现自己陷入了这种熟悉的困境。公元前513年，阿里斯蒂格勒的叔叔组氨酸陪同流士参加战斗，并要求在获得奖励后征服色雷斯领土的一部分。尽管这一点得到了批准，但组态王的野心震惊了大流士的顾问，因此组态王被迫留在苏萨，成为大流士的“皇家陪侍”。阿里斯塔戈拉斯取代了组氨酸，米利面临着沸腾的不满。公元前500年，一些纳索斯流亡者接近阿里斯蒂格勒，要求他控制岛屿。阿里斯塔戈拉斯看到有机会征服纳索斯，从而加强了他在米利都的地位，于是向吕底亚太守卫阿尔塔费伦提出了建议。如果阿尔塔费伦提供军队，阿里斯蒂格勒将征服岛屿，扩大流士帝国的边界，然后他将给阿尔塔费伦一个战利品来支付筹集军队的费用。原则上，阿尔塔费伦同意并要求大流士允许他进行远征。大流士同意了这一点，第二年，一支200人的三角部队聚集在一起攻击纳索斯。
爱奥尼亚起义：希腊几个小亚细亚地区反对波斯统治的军事叛乱